powsc

doi：10.18129/b9.bioc.powsc

单细胞RNA-seq的仿真，功率评估和样本量建议

生物导体版本：版本（3.15）

确定样本量以检测统计显着性的足够功率是高通量实验的设计阶段的关键步骤。即使在差异表达（DE）的情况下，有许多方法和工具可用于微阵列和RNA-Seq的样本量计算，但研究了单细胞RNA测序领域的该主题。此外，诸如稀疏性和异质性等SCRNA-seq中存在的独特数据特征增加了挑战。我们提出了一种基于仿真的方法POWSC，以提供功率评估和样本量建议，用于单细胞RNA测序DE分析。POWSC由一个数据模拟器组成，该数据模拟器可创建现实的表达数据，并提供对功率和样本量关系的全面评估和可视化的电源评估器。

作者：Kenong Su [Aut，Cre]，Hao Wu [aut]

维护者：kenong su

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.2”）并输入：

if（！quired（“ Biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ biocmanager”）biocmanager :: install（“ powsc”）

对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：

browsevignettes（“ powsc”）

html	R脚本	POWSC用户指南
PDF		参考手册
文本		消息

细节

生物浏览	2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯
版本	1.4.0
在生物导体中	Bioc 3.13（R-4.1）（1。5年）
执照	GPL-2
要看	r（> = 4.1），生物酶，，，，Singlecellexperiment，，，，桅杆
进口	pheatmap，，，，GGPLOT2，，，，rcolorbrewer，grdevices，总结性特征，，，，林玛
链接
建议	rmarkDown，，，，尼特，，，，测试（> = 3.0.0），生物使用
系统要求
增强
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取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包	powsc_1.4.0.tar.gz
Windows二进制	powsc_1.4.0.zip
MacOS 10.13（高山脉）	powsc_1.4.0.tgz
源存储库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/powsc
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.bioconductor.org：packages/powsc
包装短URL	//www.andersvercelli.com/packages/powsc/
软件包下载报告	下载统计