path2ppi

doi:10.18129/b9.bioc.path2ppi

与途径相关蛋白质蛋白相互作用网络的预测

生物导体版本:版本(3.15)

在目标生物中预测蛋白质 - 蛋白质相互作用(PPI)网络的包装包,仅可用有关PPI的视图信息。PATH2PPI预测基于蛋白质集的PPI网络,这些蛋白质可以属于建立良好模型生物的某种途径。它有助于将某个途径或生物过程的信息结合起来,从几种参考生物到一个靶向生物。PATH2PPI仅取决于所涉及蛋白的序列相似性。

作者:Oliver Philipp [AUT,CRE],Ina Koch [CTB]

维护者:Oliver Philipp 的联系人

引用(从r内,输入引用(“ path2ppi”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.2”)并输入:

if(!quired(“ Biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ Biocmanager”)Biocmanager :: install(“ path2ppi”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

browsevignettes(“ path2ppi”)

html R脚本 path2ppi-简短的教程
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细节

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版本 1.26.0
在生物导体中 Bioc 3.2(R-3.2)(6。5年)
执照 GPL(> = 2)
要看 r(> = 3.2.1),Igraph(> = 1.0.1),方法
进口
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建议 尼特,,,,rmarkDown,,,,运行,,,,生物基因,,,,生物使用
系统要求
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URL http://www.bioinformatik.uni-frankfurt.de/
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跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 path2ppi_1.26.0.tar.gz
Windows二进制 path2ppi_1.26.0.zip
MacOS 10.13(高山脉) path2ppi_1.26.0.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/path2ppi
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:packages/path2ppi
包装短URL //www.andersvercelli.com/packages/path2ppi/
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