PhosR

DOI:10.18129 / B9.bioc.PhosR

一套全面分析磷蛋白质组学数据的方法和工具

生物导体版本:发布(3.12)

PhosR是一个全面分析磷蛋白组学数据的软件包。PhosR有两个主要组成部分:处理和下游分析。PhosR包括各种处理磷酸盐蛋白质组学数据的工具，包括过滤、推断、归一化和推断活性激酶和信号通路的功能分析。

作者:Yang Pengyi [aut]， Taiyun Kim [aut, cre]， Jieun Hani Kim [aut]

维护者:金太云<太云。金正日在sydney.edu.au >

安装

要安装此包，请启动R(版本“4.0”)并输入:

如果(!requireNamespace(“BiocManager”，quiet = TRUE)) install.packages(“BiocManager”)BiocManager::install(“PhosR”)

有关较旧版本的R，请参阅适当的Bioconductor释放。

文档

要查看系统中安装的软件包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“PhosR”)

PDF	R脚本	PhosR封装简介
PDF		参考手册
文本		新闻
文本		许可证

细节

biocViews	2021年欧洲杯 ,2021年欧洲杯 ,2021年欧洲杯
版本	1.0.0
Bioconductor自	BioC 3.12 (R-4.0)(0.5年)
许可证	GPL-3 +文件许可证
取决于	R (> = 4.0.0)
进口	ruv,e1071,校准,dendextend,limma,pcaMethods统计数据,RColorBrewer,circlize,dplyr,igraph,pheatmap,preprocessCore,tidyr,rlang、graphics、grDevices、utils
链接
建议	testthat,knitr,GGally,网络,reshape2,线索,directPA,ggplot2,ggpubr
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用这个包的说明。

源包	PhosR_1.0.0.tar.gz
Windows二进制	PhosR_1.0.0.zip
macOS 10.13 (High Sierra)	PhosR_1.0.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/PhosR
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ PhosR
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/PhosR/
包下载报告	下载数据