甲状腺素

doi：10.18129/b9.bioc.phyloprofile

甲状腺素

生物导体版本：版本（3.15）

甲基原则是探索复杂的系统发育轮廓的工具。系统发育谱，基因在一组物种上的存在/不存在模式通常用于追踪跨物种和时间的基因的功能和进化史。使用甲基原则，我们可以通过序列/结构相似性等进一步的数据来丰富规则的系统发育谱，从而使系统发育分析更有意义。除了由R-Shiny提供动力的交互式可视化外，该软件包还提供了一系列进一步的分析功能，以获得诸如基因年龄估计或核心基因鉴定之类的见解。

作者：Vinh Tran [AUT，CRE]，Bastian Greshake Tzovaras [aut]，Ingo Ebersberger [aut]，CarlaMölbert[CTB]

维护者：vinh tran

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.2”）并输入：

if（！quired（“ Biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ Biocmanager”）Biocmanager :: install（“ thyyloprofile”）

对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：

Browsevignettes（“ Thyloprofile”）

html	R脚本	甲状腺素
PDF		参考手册
文本		消息
文本		执照

细节

生物浏览	2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯
版本	1.10.4
在生物导体中	Bioc 3.10（R-3.6）（2。5年）
执照	麻省理工学院 +文件执照
要看	R（> = 4.2.0）
进口	猿，，，，生物学家，，，，生物使用，，，，生物弦，，，，颜色，，，，Data.Table，，，，DT，，，，活力，，，，实验室，，，，GGPLOT2，，，，栅格，，，，pbapply，，，，rcolorbrewer，，，，rcurl，，，，闪亮的，，，，丝绸，，，，光泽，，，，Shinyjs，，，，omadb，，，，plyr，，，，XML2，，，，动物园，，，，Yaml
链接
建议	尼特，，，，rmarkDown，，，，测试
系统要求
增强
URL	https://github.com/bionf/phyloprofile/
BugReports	https://github.com/bionf/phyloprofile/issues
取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包	ThyloProfile_1.10.4.4.tar.gz
Windows二进制	ThyloProfile_1.10.4.4.zip
MacOS 10.13（高山脉）	PhyloProfile_1.10.4.tgz
源存储库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/phyloprofile
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.bioconductor.org：包装/支出原则
包装短URL	//www.andersvercelli.com/packages/phyloprofile/
软件包下载报告	下载统计
Bioc 3.15的旧源软件包	来源存档