Proteomm

doi：10.18129/b9.bioc.proteomm

基于多数据ASET模型的差异表达蛋白质组学分析平台

生物导体版本：版本（3.15）

Proteomm是一种统计方法，用于对单个或多个数据集执行基于模型的肽级差异表达分析。对于多个数据集，proteomm在多个数据集中为每种蛋白质产生单个折叠变化和p值。Proteomm为归一化，缺失价值插补和差异表达提供功能。基于模型的肽水平的插补和差异表达分析包装的组成部分遵循“基于自下而上的MS蛋白质组学中蛋白质定量的统计框架”中所述的分析（Karpievitch等人的BioInformatics 2009）。如图所述实现的特征归一化“使用奇异值分解的基于自下而上的MS蛋白质组学中峰强度的归一化。”（Karpievitch等人的生物信息学2009年）。

作者：Yuliya诉Karpievitch，Tim Stuart和Sufyaan Mohamed

维护者：Yuliya v Karpievitch

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.2”）并输入：

if（！quired（“ Biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ Biocmanager”）Biocmanager :: install（“ proteomm”）

对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：

browsevignettes（“ proteomm”）

html	R脚本	基于多数据ASET模型的差异表达蛋白质组学平台
PDF		参考手册
文本		消息

细节

生物浏览	2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯
版本	1.14.0
在生物导体中	Bioc 3.8（R-3.5）（3.5岁）
执照	麻省理工学院
要看	R（> = 3.5）
进口	gdata，，，，Biomart，，，，GGPLOT2，，，，Ggrepel，，，，gtools，统计矩阵，图形
链接
建议	生物使用，，，，尼特，，，，rmarkDown
系统要求
增强
URL
取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包	proteomm_1.14.0.tar.gz
Windows二进制	proteomm_1.14.0.zip
MacOS 10.13（高山脉）	proteomm_1.14.0.tgz
源存储库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/proteomm
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.bioconductor.org：packages/proteomm
包装短URL	//www.andersvercelli.com/packages/proteomm/
软件包下载报告	下载统计