河

doi：10.18129/b9.bioc.river

R河包装（RNA信息对调节的变体效应）

生物导体版本：版本（3.15）

概率建模框架的实施，该框架共同分析了个人基因组和转录组数据，以估计变体对该个体具有调节性影响的可能性。它基于一个生成模型，该模型假设基因组注释（例如变体相对于调节元素的位置）确定变体是功能性调节变体的先验概率，这是一个未观察到的变量。然后，功能调节变异状态会影响附近的基因是否可能在该人中表现出较高的基因表达水平。有关更多信息，文档和示例，请参见River网站。

作者：Yungil Kim [AUT，CRE]，Alexis Battle [AUT]

维护者：yungil kim

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.2”）并输入：

if（！quired（“ Biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ Biocmanager”）Biocmanager :: install（“ River”）

对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：

Browsevignettes（“河”）

html	R脚本	河
PDF		参考手册
文本		消息

细节

生物浏览	2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯
版本	1.20.0
在生物导体中	Bioc 3.5（R-3.4）（5年）
执照	GPL（> = 2）
要看	r（> = 3.3.2）
进口	Glmnet，，，，Proc，，，，GGPLOT2，图形，统计信息，生物酶，方法，utils
链接
建议	生物使用，，，，尼特，，，，rmarkDown，，，，测试，，，，DevTools
系统要求
增强
URL	https://github.com/ipw012/river
BugReports	https://github.com/ipw012/river/issues
取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包	River_1.20.0.tar.gz
Windows二进制	river_1.20.0.zip
MacOS 10.13（高山脉）	River_1.20.0.tgz
源存储库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/river
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.bioconductor.org：包裹/河
包装短URL	//www.andersvercelli.com/packages/river/
软件包下载报告	下载统计