rnaseqr

doi：10.18129/b9.bioc.rnaseqr

RNASEQR：用于自动化两组RNA-Seq分析工作流程的R软件包

生物导体版本：版本（3.12）

该R软件包设计用于病例对照RNA-Seq分析（两组）。有六个步骤：“ RNASEQRPARAM S4对象创建”，“环境设置”，“质量评估”，“读取和量化”，“基因级差分分析”和“功能分析”。每个步骤都对应于此软件包中的功能。按顺序运行功能后，将轻松进行基本的RNASEQ分析。

作者：kuan-hao chao

维护者：gmail.com>

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.0”）并输入：

if（！sireseenamespace（“ biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ biocmanager”）biocmanager :: install（“ rnaseqr”）

对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：

browsevignettes（“ rnaseqr”）

html	R脚本	基于一个独立变量的RNA-seq分析
PDF		参考手册
文本		消息

细节

生物浏览	2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯
版本	1.8.0
在生物导体中	Bioc 3.8（R-3.5）（2。5年）
执照	艺术2.0
要看	r（> = 3.5.0），GGPLOT2，，，，PathView，，，，EDGER， 方法
进口	rsamtools， 工具，网状，，，，舞会礼服，，，，栅格，，，，拉法里布，，，，Factominer，，，，事实，，，，Corrplot，，，，表演，，，，RESHAPE2，，，，deseq2，，，，Systempiper，，，，SystemPiperData，，，，clusterProfiler，，，，org.hs.eg.db，，，，org.sc.sgd.db，，，，Stringr，，，，pheatmap，grdevices，图形，统计，utils，剂量，，，，生物弦， 平行
链接
建议	尼特，，，，PNG， 网格，rnaseqrdata
系统要求	RNASEQR仅支持Linux和MacOS。不支持窗口。强烈建议使用Python2。如果您的计算机是Python3，请确保可用“ 2to3”命令。
增强
URL	https://github.com/howardchao/rnaseqr
BugReports	https://github.com/howardchao/rnaseqr/issues
取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包	rnaseqr_1.8.0.tar.gz
Windows二进制
MacOS 10.13（高山脉）	rnaseqr_1.8.0.tgz
源存储库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/rnaseqr
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.bioconductor.org：packages/rnaseqr
包装短URL	//www.andersvercelli.com/packages/rnaseqr/
软件包下载报告	下载统计