RNAmodR

DOI:10.18129 / B9.bioc.RNAmodR

高通量测序数据中转录后修饰的检测

生物导体版本:发布(3.13)

RNAmodR提供了加载/聚合高通量测序数据的类和工作流，目的是通过分析特定模式来检测转录后修饰。此外，还提供了实用程序来验证和可视化结果。RNAmodR包提供了一个核心功能，特定的分析策略可以作为一个单独的包轻松实现。

作者:Felix gm . Ernst， Denis L.J. Lafontaine

维护者:Felix gm Ernst < Felix .gm。恩斯特在outlook.com >

安装

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如果(!安装BiocManager::install(“RNAmodR”)

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文档

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超文本标记语言	R脚本	RNAmodR
超文本标记语言	R脚本	为新的检测策略创建新的类
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细节

biocViews	2021年欧洲杯 ，2021年欧洲杯 ，2021年欧洲杯 ，2021年欧洲杯 ，2021年欧洲杯
版本	1.6.0
Bioconductor自	BioC 3.10 (R-3.6)(1.5年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	R (> = 4.0),S4Vectors(> = 0.27.12),IRanges(> = 2.23.9),GenomicRanges，Modstrings
进口	方法、统计grDevices,matrixStats，BiocGenerics，Biostrings(> = 2.57.2),BiocParallel，GenomicFeatures，GenomicAlignments，GenomeInfoDb，rtracklayer，Rsamtools，BSgenome，RColorBrewer，colorRamps，ggplot2，Gviz(> = 1.31.0),reshape2、图形、ROCR
链接
建议	BiocStyle，knitr，rmarkdown，testthat，RNAmodR。数据
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/FelixErnst/RNAmodR
BugReports	https://github.com/FelixErnst/RNAmodR/issues
取决于我	RNAmodR。AlkAnilineSeq，RNAmodR。毫升，RNAmodR。RiboMethSeq
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用这个包的说明。

源包	RNAmodR_1.6.0.tar.gz
Windows二进制	RNAmodR_1.6.0.zip
macOS 10.13 (High Sierra)	RNAmodR_1.6.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/RNAmodR
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ RNAmodR
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/RNAmodR/
包下载报告	下载数据