生物导体版本:版本(3.12)
ROSEQ-一种基于秩的方法,用过滤和归一化读取计数矩阵建模基因表达。Roseq将过滤和归一化的读取矩阵和细胞拨入/条件作为输入,并确定单细胞对比组之间的差异表达基因。输入参数之一是要使用的核心数。
作者:Krishan Gupta [AUT,CRE],Abhik Ghosh [AUT],Debarka Sengupta [aut]
维护者:Krishan Gupta
引用(从r内,输入引用(“ Roseq”)
):
要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.0”)并输入:
if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ roseq”)
对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放。
要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:
Browsevignettes(“ Roseq”)
html | R脚本 | 罗斯 |
参考手册 | ||
文本 | 消息 | |
文本 | 执照 |
生物浏览 | 2021年欧洲杯 ,,,,2021年欧洲杯 ,,,,2021年欧洲杯 ,,,,2021年欧洲杯 |
版本 | 1.2.0 |
在生物导体中 | Bioc 3.11(R-4.0)(1年) |
执照 | GPL-3 |
要看 | R(> = 4.0) |
进口 | pbmcapply,,,,EDGER,,,,林玛 |
链接 | |
建议 | 尼特,,,,rmarkDown,,,,测试,,,,运行,,,,生物基因 |
系统要求 | |
增强 | |
URL | https://github.com/krishan57gupta/roseq |
BugReports | https://github.com/krishan57gupta/roseq/issues |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
链接到我 | |
构建报告 |
跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。
源包 | ROSEQ_1.2.0.TAR.GZ |
Windows二进制 | roseq_1.2.0.zip |
MacOS 10.13(高山脉) | ROSEQ_1.2.0.TGZ |
源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/roseq |
源存储库(开发人员访问) | git clone git@git.bioconductor.org:packages/roseq |
包装短URL | //www.andersvercelli.com/packages/roseq/ |
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