rtnsurvival

doi：10.18129/b9.bioc.rtnsurvival

使用RTN软件包推断出的转录网络的生存分析

生物导体版本：版本（3.15）

RTNSURVIVAL是将RTN软件包生成的监管与生存信息集成的工具。对于给定的调节子，2尾GSEA方法计算每个样品的差异分数（DES），然后使用所有样品的DES分布来评估同队的生存统计。有两个主要的生存分析工作流程：一种COX比例危害方法，用于模拟调节量作为生存时间的预测指标，以及基于调节活性的同类群体分层的Kaplan-Meier分析。所有图都可以按照用户的规格进行微调。

作者：Clarice S. Groeneveld，Vinicius S. Chagas，Mauro A. A. Castro

维护人员：clarice groeneveld ，毛罗A. A. A. Castro

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.2”）并输入：

if（！quired（“ Biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ Biocmanager”）Biocmanager :: install（“ rtnsurvival”）

对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：

browsevignettes（“ rtnsurvival”）

html	R脚本	RTNSurvival：使用转录网络和调节子进行多元生存分析。
PDF		参考手册
文本		消息

细节

生物浏览	2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯
版本	1.20.0
在生物导体中	Bioc 3.6（R-3.4）（4。5年）
执照	艺术2.0
要看	r（> = 3.6.3），RTN（> = 2.14.1），rtnduals（> = 1.14.1），方法
进口	生存，，，，rcolorbrewer，grdevices，图形，统计，utils，秤，，，，Data.Table，，，，蛋，，，，GGPLOT2，，，，pheatmap，，，，邓恩
链接
建议	Fletcher2013b，，，，尼特，，，，rmarkDown，，，，生物使用，，，，运行，，，，生物基因
系统要求
增强
URL
取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包	rtnsurvival_1.20.0.tar.gz
Windows二进制	rtnsurvival_1.20.0.zip
MacOS 10.13（高山脉）	rtnsurvival_1.20.0.tgz
源存储库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/rtnsurvival
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.bioconductor.org：packages/rtnsurvival
包装短URL	//www.andersvercelli.com/packages/rtnsurvival/
软件包下载报告	下载统计