Radiogx

doi:10.18129/b9.bioc.radiogx

大规模无线电基因组数据的分析

生物导体版本:版本(3.13)

用于无线电基因组分析的计算工具盒,该工具框集成了无线电响应数据,无线电生物模型和数百个癌细胞系的全面细胞系注释。“辐射组合”类可以创建和操纵标准化数据集,包括有关癌细胞系,无线电响应测定和剂量响应指标的信息。包括的方法允许使用已建立的无线电生物模型以及质量控制以验证结果来拟合和绘制剂量反应数据。包括与拟合和绘制剂量响应曲线,量化统计相关性以及曲线(AUC)或生存分数(SF)下的统计相关性和计算面积有关的其他功能。有关更多详细信息,请参阅随附的文档,参考以及:Manem,V。等(2018)

作者:Venkata Manem [aut],Petr Smirnov [aut],Ian Smith [aut],Meghan Lambie [aut],Christopher Eeles [aut],Scott Bratman [aut],Benjamin Haibe-Kains,Benjamin Haibe-kains [aut,cre,CRE]

维护者:本杰明·海布·卡因斯

引用(从r内,输入引用(“ Radiogx”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.1”)并输入:

if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ radiogx”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

Browsevignettes(“ Radiogx”)

html R脚本 RadioGX:用于分析大放射基因组数据集的R包装
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细节

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版本 1.2.0
在生物导体中 Bioc 3.12(R-4.0)(0.5岁)
执照 GPL-3
要看 r(> = 4.1),coregx
进口 总结性特征,,,,S4VECTORS,,,,生物酶, 平行,生物比较,,,,rcolorbrewer,,,,表情,,,,魔术, 方法,RESHAPE2,,,,,grdevices,图形,统计,utils,断言,,,,矩阵,,,,下载器
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源包 radiogx_1.2.0.tar.gz
Windows二进制 radiogx_1.2.0.zip
MacOS 10.13(高山脉) radiogx_1.2.0.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/radiogx
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:packages/radiogx
包装短URL //www.andersvercelli.com/packages/radiogx/
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