Bioconductor版本:发行版(3.13)
这个包提供了一个围绕流行的领结短读对齐器和SpliceMap的R包装器,SpliceMap是一个全新的拼接结发现和对齐工具。该包由QuasR生物导体包使用。我们建议使用QuasR包而不是直接使用Rbowtie。
作者:Florian Hahne, Anita Lerch, Michael B Stadler
维护者:Michael Stadler < Michael。施在fmi.ch >
引用(从R中,输入引用(“Rbowtie”)
):
要安装此包,启动R(版本“4.1”)并输入:
如果(!requireNamespace("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")
对于较老版本的R,请参考相应的Bioconductor释放.
要查看系统中安装的此包版本的文档,请从R开始并输入:
browseVignettes(“Rbowtie”)
超文本标记语言 | R脚本 | Rbowtie的介绍 |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 | |
文本 | 许可证 |
biocViews | 2021年欧洲杯 ,2021年欧洲杯 ,2021年欧洲杯 |
版本 | 1.32.0 |
Bioconductor自 | BioC 2.12 (R-3.0)(8年) |
许可证 | 艺术- 2.0 |文件许可证 |
取决于 | |
进口 | |
链接 | |
建议 | testthat平行,BiocStyle,knitr,rmarkdown |
SystemRequirements | GNU使 |
增强了 | |
URL | https://github.com/fmicompbio/Rbowtie |
BugReports | https://github.com/fmicompbio/Rbowtie/issues |
取决于我 | QuasR |
进口我 | MACPET,multicrispr |
建议我 | eisaR |
我的链接 | |
构建报告 |
遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用这个包的说明。
源包 | Rbowtie_1.32.0.tar.gz |
Windows二进制 | Rbowtie_1.32.0.zip |
macOS 10.13 (High Sierra) | Rbowtie_1.32.0.tgz |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/Rbowtie |
源存储库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/ Rbowtie |
包短Url | //www.andersvercelli.com/packages/Rbowtie/ |
包下载报告 | 下载数据 |
文档»
Bioconductor
支持»
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