雷根里奇

doi:10.18129/b9.bioc.regenrich

基因调节剂富集分析

生物导体版本:版本(3.13)

该软件包是在生物学过程中识别关键基因调节剂的管道,例如在细胞分化和刺激后细胞发育中。该管道中有四个主要步骤:(1)差分表达分析;(2)调节器目标网络推断;(3)富集分析;(4)监管机构评分和排名。

作者:Weiyang Tao [Cre,Aut],Aridaman Pandit [aut]

维护者:weiyang tao

引用(从r内,输入引用(“ Regenrich”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.1”)并输入:

if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ regenrich”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

Browsevignettes(“ Regenrich”)

html R脚本 基因调节剂富集
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文本 消息

细节

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版本 1.2.0
在生物导体中 Bioc 3.12(R-4.0)(0.5岁)
执照 GPL(> = 2)
要看 r(> = 4.0.0),S4VECTORS,,,,dplyr,,,,蒂布尔,,,,生物群,,,,总结性特征
进口 Randomforest,,,,fgsea,,,,剂量,,,,生物比较,,,,deseq2,,,,林玛,,,,WGCNA,,,,GGPLOT2(> = 2.2.0),方法,RESHAPE2,,,,马格里特
链接
建议 地球,,,,rmarkDown,,,,尼特,,,,生物管理器,,,,测试
系统要求
增强
URL
取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 regenrich_1.2.0.tar.gz
Windows二进制 regenrich_1.2.0.zip
MacOS 10.13(高山脉) regenrich_1.2.0.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/regenrich
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:包装/regenrich
包装短URL //www.andersvercelli.com/packages/regenrich/
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