生物导体版本:版本(3.13)
该软件包是在生物学过程中识别关键基因调节剂的管道,例如在细胞分化和刺激后细胞发育中。该管道中有四个主要步骤:(1)差分表达分析;(2)调节器目标网络推断;(3)富集分析;(4)监管机构评分和排名。
作者:Weiyang Tao [Cre,Aut],Aridaman Pandit [aut]
维护者:weiyang tao
引用(从r内,输入引用(“ Regenrich”)
):
要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.1”)并输入:
if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ regenrich”)
对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放。
要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:
Browsevignettes(“ Regenrich”)
html | R脚本 | 基因调节剂富集 |
参考手册 | ||
文本 | 消息 |
生物浏览 | 2021年欧洲杯 ,,,,2021年欧洲杯 ,,,,2021年欧洲杯 ,,,,2021年欧洲杯 ,,,,2021年欧洲杯 ,,,,2021年欧洲杯 ,,,,2021年欧洲杯 ,,,,2021年欧洲杯 ,,,,2021年欧洲杯 ,,,,2021年欧洲杯 ,,,,2021年欧洲杯 ,,,,2021年欧洲杯 ,,,,2021年欧洲杯 |
版本 | 1.2.0 |
在生物导体中 | Bioc 3.12(R-4.0)(0.5岁) |
执照 | GPL(> = 2) |
要看 | r(> = 4.0.0),S4VECTORS,,,,dplyr,,,,蒂布尔,,,,生物群,,,,总结性特征 |
进口 | Randomforest,,,,fgsea,,,,剂量,,,,生物比较,,,,deseq2,,,,林玛,,,,WGCNA,,,,GGPLOT2(> = 2.2.0),方法,RESHAPE2,,,,马格里特 |
链接 | |
建议 | 地球,,,,rmarkDown,,,,尼特,,,,生物管理器,,,,测试 |
系统要求 | |
增强 | |
URL | |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
链接到我 | |
构建报告 |
跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。
源包 | regenrich_1.2.0.tar.gz |
Windows二进制 | regenrich_1.2.0.zip |
MacOS 10.13(高山脉) | regenrich_1.2.0.tgz |
源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/regenrich |
源存储库(开发人员访问) | git clone git@git.bioconductor.org:包装/regenrich |
包装短URL | //www.andersvercelli.com/packages/regenrich/ |
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