ReportingTools.

DOI：10.18129 / b9.bioc.reportingtools.

以各种格式进行报告的工具

Biocometiond版本：释放（3.12）

ReportingTools软件包使用户能够轻松地显示从诸如微阵列和测序数据等源产生的分析结果的报告。该软件包允许用户创建可以在Web浏览器（如Safari）上查看的HTML页面，或以其他格式（如Excel）可读的格式。用户可以使用可排序和可过滤列，制作和显示绘图的表，并将表条目链接到其他数据源（如HTML页面中的NCBI或更大的绘图）。使用包，用户还可以生成一个目录页面，以将各种报告链接在一起，以便在Web浏览器中查看的特定项目。有关更多示例，请访问我们的网站：http：// shopary-pub.gene.com/reportingtools。

作者：Jason A. Hackney，Melanie Huntley，Jessica L. Larson，Christina Chaivorapol，Gabriel Becker和Josh Kaminker

维护者：Jason A. Hackney Gabriel Becker ，Jessica L. Larson

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“4.0”）并输入：

if（！percenameSpace（“biocmanager”，squilly = true））install.packages（“biocmanager”）biocmanager ::安装（“reportingtools”）

对于旧版本，请参阅相应的生物导体释放。

文件

要查看系统中安装此包版本的文档，请启动r并输入：

BROWSEVIGNETTES（“ReportingTools”）

HTML.	r script.	Knitr和ReportingTools.
PDF.	r script.	报告微阵列差异表达
PDF.	r script.	报告RNA-SEQ差异表达
PDF.	r script.	ReportingTools基础知识
PDF.	r script.	ReportingTools闪亮
PDF.		参考手册
文本		消息

细节

Biocviews.	2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯
版本	2.30.0
在生物导体中以来	BIOC 2.11（R-2.15）（8.5岁）
执照	艺术-2.0
依靠	方法，kn，实用程序
进口	BioBase.那HWRITER.那类别那古司裤那林马（> = 3.17.5），格子那annotationdbi.那edger.那注释那pfam.db.那GSEABASE.那生物根系（> = 0.1.6），网格，XML.那R.utils.那deseq2.（> = 1.3.41），ggplot2.那GGBIO.那绞喉
链接到
建议	运行那全部那hgu95av2.db.那org.mm.eg.db.那闪亮的那帕西拉那org.sc.sgd.db.
系统要求
加强
URL.
取决于我	rnaseqgene.
进口我	倍感工具
建议我	cpvsnp.那enrichmentbrowser.那GSEABASE.那NPGSEA.
链接给我
建立报告

包档案包

跟随2021年欧洲杯比分预测 在r会话中使用此包的说明。

源包	ReportingTools_2.30.0.tar.gz.
Windows二进制文件	ReportingTools_2.30.0.zip.（32-＆64位）
Macos 10.13（高塞拉）	ReportingTools_2.30.0.tgz.
源存储库	git clone https://git.biocumon.org/packages/reportingtools.
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.biocondion.org：包/ eportingTools
包短网址	https://biocumon.org/packages/reportingtools/
包裹下载报告	下载统计信息