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Rhisat2.
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DOI：10.18129 / b9.bioc.rhisat2.
HARAT2对齐器的R包装器
Bioconductor版本：释放（3.13）
通过Kim等人的Hisat2剪接短读对齐器的R接口。（2015）。包包含包装器函数来创建基因组索引并执行生成索引的读对齐。
作者：夏洛特·斯蒙顿[AUT，CRE]
维护者：Charlotte Soneson
引文（从R内，输入引文（“Rhisat2”））：
安装
要安装此软件包，请启动R（版本“4.1”）并输入：
if（！percennamespace（“biocmanager”，静静= true））install.packages（“biocmanager”）biocmanager ::安装（“Rhisat2”）
对于旧版本，请参阅相应的生物导体释放。
文件
要查看系统中安装此包版本的文档，请启动r并输入：
BROWSEVIGNETTES（“RHISAT2”）
| HTML. | r script. | Rhisat2. |
| PDF. | 参考手册 | |
| 文本 | 消息 | |
| 文本 | 执照 |
细节
| Biocviews. | 2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 |
| 版本 | 1.8.0. |
| 在生物导体中以来 | BIOC 3.9（R-3.6）（2年） |
| 执照 | GPL-3. |
| 依靠 | r（> = 3.6） |
| 进口 | 基因组法那SGSEQ.那Genomicranges.，方法，utils |
| 链接到 | |
| 建议 | testthat.那kn那RAMAMAMDOW.那生物焦 |
| 系统要求 | GNU制作 |
| 加强 | |
| URL. | https://github.com/fmicompbio/rhisat2. |
| Bugreports. | https://github.com/fmicompbio/rhisat2/issues. |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | Quasr. |
| 链接给我 | |
| 建立报告 |
包档案包
跟随2021年欧洲杯比分预测 在r会话中使用此包的说明。
| 源包 | Rhisat2_1.8.0.tar.gz. |
| Windows二进制文件 | RHISAT2_1.8.0.zip. |
| Macos 10.13（高塞拉） | RHISAT2_1.8.0.TGZ. |
| 源存储库 | git clone https://git.biocumon.org/packages/rhisat2. |
| 源存储库（开发人员访问） | git clone git@git.biocondion.org：包/ rhisat2 |
| 包短网址 | https://biocumon.org/packages/rhisat2/ |
| 包裹下载报告 | 下载统计信息 |
