Risa

doi:10.18129/b9.bioc.risa

将实验元数据从ISA-TAB转换为生物导体数据结构

生物导体版本:版本(3.15)

调查 /研究 /测定(ISA)选项卡 - 限制格式是一个通用框架,可以通过该框架收集和交流复杂的元数据(即样品特征,所使用的技术,测量类型,测量的类型),该实验采用了从传统的技术组合进行实验,高通量技术的方法。RISA允许以ISA-TAB格式访问元数据/数据并构建生物导体数据结构。当前,支持由微阵列,流式细胞术和基于代谢组学(即质谱)测定产生的数据。该软件包是可扩展的,并且正在努力支持与蛋白质组学测定相关的元数据。

作者:Alejandra Gonzalez-Beltran,Audrey Kauffmann,Steffen Neumann,Gabriella Rustici,ISA团队

维护者:Alejandra Gonzalez-Beltran

引用(从r内,输入引用(“ Risa”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.2”)并输入:

if(!quired(“ Biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ Biocmanager”)Biocmanager :: install(“ risa”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

Browsevignettes(“ Risa”)

PDF R脚本 RISA:将实验元数据从ISA-TAB转换为生物导体数据结构
PDF 参考手册
文本 消息

细节

生物浏览 2021年欧洲杯 ,,,,2021年欧洲杯 ,,,,2021年欧洲杯 ,,,,2021年欧洲杯
版本 1.38.0
在生物导体中 Bioc 2.11(R-2.15)(9。5年)
执照 LGPL
要看 r(> = 2.0.9),生物酶(> = 2.4.0),方法,RCPP(> = 0.9.13),生物浏览,,,,副词
进口 XCMS
链接
建议 法阿科(> = 1.2.11)
系统要求
增强
URL http://www.isa-tools.org/
BugReports https://github.com/isa-tools/risa/issues
取决于我
进口我
建议我 mtbls2
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 risa_1.38.0.tar.gz
Windows二进制 risa_1.38.0.zip(仅64位)
MacOS 10.13(高山脉) risa_1.38.0.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/risa
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:packages/risa
包装短URL //www.andersvercelli.com/packages/risa/
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