生物导体版本:版本(3.15)
调查 /研究 /测定(ISA)选项卡 - 限制格式是一个通用框架,可以通过该框架收集和交流复杂的元数据(即样品特征,所使用的技术,测量类型,测量的类型),该实验采用了从传统的技术组合进行实验,高通量技术的方法。RISA允许以ISA-TAB格式访问元数据/数据并构建生物导体数据结构。当前,支持由微阵列,流式细胞术和基于代谢组学(即质谱)测定产生的数据。该软件包是可扩展的,并且正在努力支持与蛋白质组学测定相关的元数据。
作者:Alejandra Gonzalez-Beltran,Audrey Kauffmann,Steffen Neumann,Gabriella Rustici,ISA团队
维护者:Alejandra Gonzalez-Beltran
引用(从r内,输入引用(“ Risa”)
):
要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.2”)并输入:
if(!quired(“ Biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ Biocmanager”)Biocmanager :: install(“ risa”)
对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放。
要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:
Browsevignettes(“ Risa”)
R脚本 | RISA:将实验元数据从ISA-TAB转换为生物导体数据结构 | |
参考手册 | ||
文本 | 消息 |
生物浏览 | 2021年欧洲杯 ,,,,2021年欧洲杯 ,,,,2021年欧洲杯 ,,,,2021年欧洲杯 |
版本 | 1.38.0 |
在生物导体中 | Bioc 2.11(R-2.15)(9。5年) |
执照 | LGPL |
要看 | r(> = 2.0.9),生物酶(> = 2.4.0),方法,RCPP(> = 0.9.13),生物浏览,,,,副词 |
进口 | XCMS |
链接 | |
建议 | 法阿科(> = 1.2.11) |
系统要求 | |
增强 | |
URL | http://www.isa-tools.org/ |
BugReports | https://github.com/isa-tools/risa/issues |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | mtbls2 |
链接到我 | |
构建报告 |
跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。
源包 | risa_1.38.0.tar.gz |
Windows二进制 | risa_1.38.0.zip(仅64位) |
MacOS 10.13(高山脉) | risa_1.38.0.tgz |
源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/risa |
源存储库(开发人员访问) | git clone git@git.bioconductor.org:packages/risa |
包装短URL | //www.andersvercelli.com/packages/risa/ |
软件包下载报告 | 下载统计 |
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