RnBeads

DOI:10.18129 / B9.bioc.RnBeads

RnBeads

生物导体版本:发布(3.12)

RnBeads有助于全面分析基因组规模上各种类型的DNA甲基化数据。

作者:Yassen Assenov [aut]， Pavlo Lutsik [aut]， Michael Scherer [aut]， Fabian Mueller [aut, cre]

维护者:Fabian Mueller

安装

要安装此包，请启动R(版本“4.0”)并输入:

如果(!安装BiocManager::install("RnBeads")

有关较旧版本的R，请参阅适当的Bioconductor释放。

文档

要查看系统中安装的软件包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“RnBeads”)

PDF	R脚本	RnBeads综合DNA甲基化分析
PDF	R脚本	RnBeads注释
PDF		参考手册
文本		自述
文本		新闻

细节

biocViews	2021年欧洲杯 ,2021年欧洲杯 ,2021年欧洲杯 ,2021年欧洲杯 ,2021年欧洲杯 ,2021年欧洲杯 ,2021年欧洲杯 ,2021年欧洲杯 ,2021年欧洲杯 ,2021年欧洲杯 ,2021年欧洲杯 ,2021年欧洲杯 ,2021年欧洲杯 ,2021年欧洲杯
版本	2.8.0
Bioconductor自	BioC 3.1 (R-3.2)(6年)
许可证	GPL-3
取决于	R (> = 3.0.0),BiocGenerics,S4Vectors(> = 0.9.25),GenomicRanges,质量,集群,ff,字段,ggplot2(> = 0.9.2),gplots,gridExtra,limma,matrixStats、方法、illuminaio,methylumi,plyr
进口	IRanges
链接
建议	类别,GOstats,Gviz,IlluminaHumanMethylation450kmanifest,RPMM,RefFreeEWAS,RnBeads.hg19,RnBeads.mm9,XML,注释,biomaRt,foreach,doParallel,ggbio,isva,mclust,mgcv,minfi,nlme,org.Hs.eg.db,org.Mm.eg.db,org.Rn.eg.db,quadprog,rtracklayer,qvalue,股东价值分析,西瓜,wordcloud,qvalue,argparse,glmnet,很高兴,IlluminaHumanMethylation450kanno.ilmn12.hg19,尺度,missMethyl,嫁祸于,闪亮的,shinyjs,plotrix,hexbin,RUnit,MethylSeekR
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我	RnBeads.hg19,RnBeads.hg38,RnBeads.mm10,RnBeads.mm9,RnBeads.rn5
我的链接
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用这个包的说明。

源包	RnBeads_2.8.0.tar.gz
Windows二进制	RnBeads_2.8.0.zip(32位和64位)
macOS 10.13 (High Sierra)	RnBeads_2.8.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/RnBeads
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ RnBeads
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/RnBeads/
包下载报告	下载数据