RnaSeqSampleSize

DOI:10.18129 / B9.bioc.RnaSeqSampleSize

此包适用于Bioconductor 3.12版。此包已从Bioconductor中删除。有关最新的稳定发布版本，请参见RnaSeqSampleSize．

RnaSeqSampleSize

Bioconductor版本:发行版(3.12)

RnaSeqSampleSize包提供了一种基于负二项式模型的样本量计算方法和评估RNA-seq数据差异表达分析的精确测试。它控制FDR进行多次测试，并利用来自真实数据的平均读取计数和分散分布来估计更可靠的样本量。它还具有一些独特的功能，包括感兴趣的基因或途径的估计，功率曲线可视化和参数优化。

作者:赵世林开发人员[aut, cre]，李忠义开发人员[aut]，郭燕开发人员[aut]，盛泉湖开发人员[aut]，于夏尔开发人员[aut]

维护人员:赵世林开发者

安装

要安装此包，请启动R(版本“4.0”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE) install.packages("BiocManager") BiocManager::install("RnaSeqSampleSize")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“RnaSeqSampleSize”)

PDF	R脚本	RnaSeqSampleSize:根据真实数据估计样本量
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	2021年欧洲杯 ，2021年欧洲杯 ，2021年欧洲杯 ，2021年欧洲杯 ，2021年欧洲杯 ，2021年欧洲杯 ，2021年欧洲杯
版本	2.0.0
在Bioconductor	BioC 3.1 (R-3.2)(6年)
许可证	GPL (>= 2)
取决于	R (>= 4.0.0)，RnaSeqSampleSizeData
进口	biomaRt，刨边机，heatmap3，matlab，KEGGREST，方法，grDevices，图形，统计，utils，Rcpp(> = 0.11.2)
链接	Rcpp
建议	BiocStyle，knitr，testthat
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。

源包	RnaSeqSampleSize_2.0.0.tar.gz
Windows二进制	RnaSeqSampleSize_2.0.0.zip
macOS 10.13 (High Sierra)	RnaSeqSampleSize_2.0.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/RnaSeqSampleSize
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/RnaSeqSampleSize
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/RnaSeqSampleSize/
软件包下载报告	下载数据