SC3

doi:10.18129/b9.bioc.sc3

单细胞共识聚类

生物导体版本:版本(3.15)

一种用于无监督聚类和分析单细胞RNA-seq数据的工具。

作者:Vladimir Kiselev

维护者:vladimir kiselev

引用(从r内,输入引用(“ SC3”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.2”)并输入:

if(!quired(“ Biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ Biocmanager”)Biocmanager :: install(“ SC3”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

Browsevignettes(“ SC3”)

html R脚本 SC3包装手册
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细节

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版本 1.24.0
在生物导体中 Bioc 3.3(R-3.3)(6年)
执照 GPL-3
要看 R(> = 3.3)
进口 图形,统计,utils,方法,E1071, 平行,foreach,,,,多帕尔,,,,Dorng,,,,闪亮的,,,,GGPLOT2,,,,pheatmap(> = 1.0.8),rocr,,,,鲁棒,,,,rrcov,,,,,,,,writexls,,,,RCPP(> = 0.11.1),总结性特征,,,,Singlecellexperiment,,,,生物基因,,,,S4VECTORS
链接 RCPP,,,,rcpparmadillo
建议 尼特,,,,rmarkDown,,,,mclust,,,,评分
系统要求
增强
URL https://github.com/hemberg-lab/sc3
BugReports https://support.bioconductor.org/t/sc3/
取决于我
进口我 盛宴
建议我 Interactivecomplexheatmap,,,,Sctreeviz,,,,VAEXPRS
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 sc3_1.24.0.tar.gz
Windows二进制 sc3_1.24.0.zip
MacOS 10.13(高山脉) sc3_1.24.0.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/sc3
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:packages/sc3
包装短URL //www.andersvercelli.com/packages/sc3/
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