Scarray

doi：10.18129/b9.bioc.scarray

带有GDS文件的大型单细胞RNA-seq数据操作

生物导体版本：版本（3.15）

使用基因组数据结构（GDS）文件提供大规模的单细胞RNA-seq数据操作。它结合了存储在GDS文件中的密集和稀疏矩阵以及使用R编程语言的生物导体基础架构框架（SingleCellexperiment和delayerDarray），以提供存储外数据存储和大规模操作。

作者：Xiuwen Zheng [AUT，CRE]

维护者：xiuwen Zheng

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.2”）并输入：

if（！quired（“ Biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ Biocmanager”）Biocmanager :: install（“ scarray”）

对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：

Browsevignettes（“ Scarray”）

html		概述
html	R脚本	使用GDS文件的单细胞RNA-seq数据操作
PDF		参考手册
文本		消息

细节

生物浏览	2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯
版本	1.4.0
在生物导体中	Bioc 3.13（R-4.1）（1年）
执照	GPL-3
要看	r（> = 3.5.0），GDSFMT（> = 1.27.4），方法，延迟（> = 0.16.0）
进口	生物基因，，，，S4VECTORS，，，，iranges，utils，总结性特征，，，，Singlecellexperiment，，，，延迟的matrixstats
链接
建议	矩阵，，，，评分，，，，UWOT，，，，运行，，，，尼特，，，，降价，，，，rmarkDown，，，，RHDF5，，，，HDF5Array
系统要求
增强
URL	https://github.com/abbvie-computationalgenomics/scarray
取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包	scarray_1.4.0.tar.gz
Windows二进制	scarray_1.4.0.zip
MacOS 10.13（高山脉）	scarray_1.4.0.tgz
源存储库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/scarray
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.bioconductor.org：包装/scarray
包装短URL	//www.andersvercelli.com/packages/scarray/
软件包下载报告	下载统计