- 家
- Biocumon 3.13
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- Sictools.
Sictools.
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DOI：10.18129 / b9.bioc.sictools.
在具有近似关系的两个BAM文件之间找到SNV / indel差异
Bioconductor版本：释放（3.13）
此包是在两个BAB文件之间找到SNV / indel差异，其与近在咫尺的接近关系的接近关系，每个基因组的每个基因区域的每个基位位置。Fisher试验和欧几里德距离推断出差异，其输入是给定位置的基数（A，T，G，C），并且在Indel区域的两侧跨越不小于2bp的凹凸计数。
作者：小波兴，吴伟
维护者：小波兴<小波Xing0316在Gmail.com>
引文（从R内，输入引文（“Sictools”））：
安装
要安装此软件包，请启动R（版本“4.1”）并输入：
if（！percennamespace（“biocmanager”，squilly = true））install.packages（“biocmanager”）biocmanager ::安装（“sictools”）
对于旧版本，请参阅相应的生物导体释放。
文件
要查看系统中安装此包版本的文档，请启动r并输入：
BROWSEVIGNETTES（“SICTOOLS”）
| PDF. | r script. | 使用sictools. |
| PDF. | 参考手册 | |
| 文本 | 消息 |
细节
| Biocviews. | 2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 |
| 版本 | 1.22.0 |
| 在生物导体中以来 | BIOC 3.2（R-3.2）（5.5岁） |
| 执照 | GPL（> = 2） |
| 依靠 | R（> = 3.0.0），方法，RSAMTOOLS.（> = 1.18.1），多达齐全（> = 1.0.8），生物仪器（> = 2.32.1），stringr.（> = 0.6.2），MatrixStats.（> = 0.10.0），普利尔（> = 1.8.3），Genomicranges.（> = 1.22.4），绞喉（> = 2.4.8） |
| 进口 | |
| 链接到 | |
| 建议 | kn那运行那生物根系 |
| 系统要求 | |
| 加强 | |
| URL. | |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 链接给我 | |
| 建立报告 |
包档案包
跟随2021年欧洲杯比分预测 在r会话中使用此包的说明。
| 源包 | sictools_1.22.0.tar.gz. |
| Windows二进制文件 | |
| Macos 10.13（高塞拉） | sictools_1.22.0.tgz. |
| 源存储库 | git clone https://git.biocumon.org/packages/sictools. |
| 源存储库（开发人员访问） | git clone git@git.biocondion.org：包装/ sictools |
| 包短网址 | https://biocumon.org/packages/sictools/ |
| 包裹下载报告 | 下载统计信息 |
