SPIA

DOI:10.18129 / B9.bioc.SPIA

信号通路影响分析(SPIA)使用信号通路过度表征和异常信号干扰的综合证据

生物导体版本:发布(3.13)

该包实现了信号通路影响分析(SPIA)，它利用信息形成差异表达基因的列表及其日志折叠变化，并结合信号通路拓扑，以确定与研究条件最相关的通路。

作者:Adi Laurentiu Tarca ， Purvesh Kathri < Purvesh at cs.wayne.edu>， Sorin Draghici < Sorin at wayne.edu>

维护者:Adi Laurentiu Tarca

安装

要安装此包，请启动R(版本“4.1”)并输入:

如果(!安装BiocManager::install("SPIA")

有关较旧版本的R，请参阅适当的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的软件包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“SPIA”)

PDF	R脚本	SPIA
PDF		参考手册
文本		许可证

细节

biocViews	2021年欧洲杯 ，2021年欧洲杯 ，2021年欧洲杯
版本	2.44.0
Bioconductor自	BioC 2.4 (R-2.9)(12年)
许可证	文件许可证
取决于	R (>= 2.14.0)， graphics，KEGGgraph
进口	图形
链接
建议	图，Rgraphviz，hgu133plus2.db
SystemRequirements
增强了
URL	http://bioinformatics.oxfordjournals.org/cgi/reprint/btn577v1
取决于我
进口我	EnrichmentBrowser
建议我	石墨，KEGGgraph
我的链接
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用这个包的说明。

源包	SPIA_2.44.0.tar.gz
Windows二进制	SPIA_2.44.0.zip
macOS 10.13 (High Sierra)	SPIA_2.44.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/SPIA
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ SPIA
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/SPIA/
包下载报告	下载数据