生物导体版本:发布(3.13)
提供工具来分析不同的剪接位点,根据序列信息解释结果,选择和设计引物来验证位点,并给出事件的视觉表现来指导下游实验。
作者:戴安娜·罗
维护者:Diana Low
引文(从R中输入引用(“分裂”)
):
要安装此包,请启动R(版本“4.1”)并输入:
如果(!安装BiocManager::install(“SPLINTER”)
有关较旧版本的R,请参阅适当的Bioconductor释放.
要查看系统中安装的软件包版本的文档,请启动R并输入:
browseVignettes(“分裂”)
R脚本 | 分裂 | |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | 2021年欧洲杯 ,2021年欧洲杯 ,2021年欧洲杯 ,2021年欧洲杯 ,2021年欧洲杯 ,2021年欧洲杯 |
版本 | 1.18.0 |
Bioconductor自 | BioC 3.4 (R-3.3)(4.5年) |
许可证 | GPL-2 |
取决于 | R (>= 3.6.0), grDevices, stats |
进口 | 图形,ggplot2,seqLogo,Biostrings,biomaRt,GenomicAlignments,GenomicRanges,GenomicFeatures,Gviz,IRanges,S4Vectors,GenomeInfoDb跑龙套,plyr,stringr、方法、BSgenome.Mmusculus.UCSC.mm9,googleVis |
链接 | |
建议 | BiocStyle,knitr,rmarkdown |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | https://github.com/dianalow/SPLINTER/ |
BugReports | https://github.com/dianalow/SPLINTER/issues |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
我的链接 | |
构建报告 |
遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用这个包的说明。
源包 | SPLINTER_1.18.0.tar.gz |
Windows二进制 | SPLINTER_1.18.0.zip |
macOS 10.13 (High Sierra) | SPLINTER_1.18.0.tgz |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/SPLINTER |
源存储库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/分裂 |
包短Url | //www.andersvercelli.com/packages/SPLINTER/ |
包下载报告 | 下载数据 |
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