海绵

doi:10.18129/b9.bioc.sponge

基因表达的稀疏部分相关性

生物导体版本:版本(3.13)

该软件包提供了有效检测两个基因之间竞争性内生RNA相互作用的方法。这种相互作用是由一个或几个miRNA介导的,因此需要大量样品作为输入的基因和miRNA表达数据。

作者:Markus List,Azim Dehghani Amirabad,Dennis Kostka,Marcel H. Schulz

维护者:Markus列表

引用(从r内,输入引用(“海绵”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.1”)并输入:

if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ Sponge”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

Browsevignettes(“海绵”)

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细节

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版本 1.14.0
在生物导体中 Bioc 3.6(R-3.4)(3.5岁)
执照 GPL(> = 3)
要看 R(> = 3.4)
进口 生物酶,统计ppcor,,,,记录,,,,foreach,,,,Dorng,,,,Data.Table,,,,大量的,,,,expm,,,,Grbase,,,,Glmnet,,,,Igraph,,,,迭代器
链接
建议 测试,,,,尼特,,,,rmarkDown,,,,Visnetwork,,,,GGPLOT2,,,,Ggrepel,,,,栅格,,,,消化,,,,多帕尔,,,,BigMemory
系统要求
增强
URL
取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 Sponge_1.14.0.tar.gz
Windows二进制 Sponge_1.14.0.zip
MacOS 10.13(高山脉) Sponge_1.14.0.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/sponge
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:包装/海绵
包装短URL //www.andersvercelli.com/packages/sponge/
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