基质4

doi:10.18129/b9.bioc.stroma4

为TNBC患者分配特性

生物导体版本:版本(3.15)

该软件包估计了在基因表达数据集的每位患者中,TNBC患者中鉴定出的四个基质特性。这些基质性质分配可以与亚型患者合并。在三重阴性乳腺癌(TNBC)患者中鉴定了这四个基质特性,代表基质中不同细胞的存在:T细胞(T),B细胞(B),基质浸润上皮细胞(E)和脱粒质细胞(d)。此外,该软件包还可以用于估计Lehmann亚型的生成性质,这是一种替代TNBC亚型方案(PMID:21633166)。

作者:Sadiq Saleh [AUT,CRE],Michael Hallett [AUT]

维护者:sadiq Saleh

引用(从r内,输入引用(“ Stroma4”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.2”)并输入:

if(!quired(“ Biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ Biocmanager”)Biocmanager :: install(“ Stroma4”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

Browsevignettes(“ Stroma4”)

PDF R脚本 使用Stroma4包装
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细节

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版本 1.20.0
在生物导体中 Bioc 3.5(R-3.4)(5年)
执照 GPL-3
要看 r(> = 3.4),生物酶,,,,生物比较,,,,,,,,矩阵,统计,图形,utils
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建议 乳腺癌
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源包 Stroma4_1.20.0.tar.gz
Windows二进制 Stroma4_1.20.0.zip(仅64位)
MacOS 10.13(高山脉) Stroma4_1.20.0.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/stroma4
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:packages/stroma4
包装短URL //www.andersvercelli.com/packages/stroma4/
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