SEQGATE.

DOI：10.18129 / b9.bioc.seqgate.

过滤低表达的功能

Biocometiond版本：释放（3.12）

滤波低表达的特征（例如基因）是在执行统计分析之前的常见步骤，但通常选择任意阈值。SEQGATE实现了一种方法，通过分析复制样本中的计数的分析来合理化这一步骤。门是高于哪个阈值，该阈值可以被认为是可信地定量的。

作者：ChristelleReynès[Aut]，StéphanieRialle[Aut，Cre]

维护者：StéphanieRialle

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“4.0”）并输入：

if（！percennamespace（“biocmanager”，squilly = true））install.packages（“biocmanager”）biocmanager ::安装（“seqgate”）

对于旧版本，请参阅相应的生物导体释放。

文件

要查看系统中安装此包版本的文档，请启动r并输入：

BROWSEVIGNETTES（“SEQGATE”）

HTML.	r script.	SEQGATE：过滤差别表达的功能
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细节

Biocviews.	2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯
版本	1.0.1
在生物导体中以来	BIOC 3.12（R-4.0）（<6个月）
执照	gpl（> = 2.0）
依靠	S4Vectors.那概括分析那Genomicranges.
进口	统计，方法，Biocmanager.
链接到
建议	testthat.那edger.那生物焦那kn那RAMAMAMDOW.
系统要求
加强
URL.
Bugreports.	https://github.com/srialle/seqgate/issues.
取决于我
进口我
建议我
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包档案包

跟随2021年欧洲杯比分预测 在r会话中使用此包的说明。

源包	seqgate_1.0.1.tar.gz.
Windows二进制文件	seqgate_1.0.1.zip.
Macos 10.13（高塞拉）	seqgate_1.0.1.tgz.
源存储库	git clone https://git.biocumon.org/packages/seqgate.
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.biocondion.org：包装/ seqgate
包短网址	https://biocumon.org/packages/seqgate/
包裹下载报告	下载统计信息
BIOC 3.12的旧源包	源档案