SEQVARTOOLS.

DOI:10.18129 / b9.bioc.seqvartools.

变体数据的工具

Bioconductor版本:释放(3.13)

在SEQARRAY中提供的VCF数据的快速访问存储格式的接口,具有用于共同操作和分析的工具。

作者:Stephanie M. Gogarten,Ziuwen Zheng,Adrienne Stilp

维护者:斯蒂芬妮M. Gogarten

引文(从R内,输入引文(“SEQVARTOOLS”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“4.1”)并输入:

if(!percennamespace(“biocmanager”,squilly = true))install.packages(“biocmanager”)biocmanager ::安装(“seqvartools”)

对于旧版本,请参阅相应的生物导体释放

文件

要查看系统中安装此包版本的文档,请启动r并输入:

BROWSEVIGNETTES(“SEQVARTOOLS”)

PDF. r script. SEQVARTOOLS介绍
PDF. r script. SEQVARTOOLS中的迭代器
PDF. 参考手册
文本 消息

细节

Biocviews. 2021年欧洲杯 2021年欧洲杯 2021年欧洲杯 2021年欧洲杯 2021年欧洲杯
版本 1.30.0.
在生物导体中以来 BIOC 2.13(R-3.0)(7.5岁)
执照 GPL-3
依靠 SEQARRAY.
进口 grdevices,图形,统计数据,方法,BioBase.生物根系GDSFMT.Genomicranges.绞喉S4Vectors.gwasexacthwLogistf.矩阵data.table.
链接到
建议 生物焦运行stringr.
系统要求
加强
URL. https://github.com/smgogarten/seqvartools.
取决于我
进口我 创世纪variantexperiment.
建议我
链接给我
建立报告

包档案包

跟随2021年欧洲杯比分预测 在r会话中使用此包的说明。

源包 seqvartools_1.30.0.tar.gz.
Windows二进制文件 seqvartools_1.30.0.zip.(32-&64位)
Macos 10.13(高塞拉) seqvartools_1.30.0.tgz.
源存储库 git clone https://git.biocumon.org/packages/seqvartools.
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.biocondion.org:包/ seqvartools
包短网址 https://biocumon.org/packages/seqvartools/
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文件»

生物体

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支持»

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  • 支持网站- 关于生物导体包的问题
  • Bioc-devel.邮件列表 - 适用于包开发人员2021欧洲杯体育投注开户