sigspack

doi：10.18129/b9.bioc.sigspack

单个样品的突变签名估计

生物导体版本：版本（3.13）

暴露于突变特征的单个样本估计。基于二次编程算法，估计了对单个样品的已知突变特征的暴露。引导输入突变目录提供了有关这些暴露稳定性的估计。可以通过标准化目录来考虑突变环境的序列组成的效果。

作者：franziska schumann

维护者：franziska schumann

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.1”）并输入：

if（！sireseenamespace（“ biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ biocmanager”）biocmanager :: install（“ sigspack”）

对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：

browsevignettes（“ sigspack”）

html	R脚本	Sigspack简介
PDF		参考手册
文本		消息

细节

生物浏览	2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯
版本	1.6.0
在生物导体中	Bioc 3.10（R-3.6）（1。5年）
执照	GPL-3
要看	R（> = 3.6）
进口	Quadprog（> = 1.5-5），方法，生物酶，，，，BSGENOME（> = 1.46.0），变体（> = 1.24.5），生物弦，，，，GenomeInfodB，，，，基因组机，，，，rtracklayer，，，，总结性特征，图形，统计，utils
链接
建议	iranges，，，，bsgenome.hsapiens.ucsc.hg19，，，，生物使用，，，，尼特，，，，rmarkDown
系统要求
增强
URL	https://github.com/bihealth/sigspack
BugReports	https://github.com/bihealth/sigspack/issues
取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包	sigspack_1.6.0.tar.gz
Windows二进制	sigspack_1.6.0.zip
MacOS 10.13（高山脉）	sigspack_1.6.0.tgz
源存储库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/sigspack
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.bioconductor.org：packages/sigspack
包装短URL	//www.andersvercelli.com/packages/sigspack/
软件包下载报告	下载统计