辛格

doi:10.18129/b9.bioc.singler

基于参考的单细胞RNA-seq注释

生物导体版本:版本(3.15)

通过利用纯细胞类型的参考转录组数据集来独立推断每个单个单元的原点细胞,从而从单细胞RNA测序数据中执行无偏的细胞类型识别。

作者:Dvir Aran [AUT,CPH],Aaron Lun [CTB,CRE],Daniel Bunis [CTB],Jared Andrews [CTB],FriederikeDündar[CTB]

维护者:aaron lun

引用(从r内,输入引用(“ Singler”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.2”)并输入:

if(!quired(“ Biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ Biocmanager”)Biocmanager :: install(“ Singler”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

Browsevignettes(“ Singler”)

html R脚本 注释SCRNA-SEQ数据
PDF 参考手册
文本 消息
文本 执照

细节

生物浏览 2021年欧洲杯 ,,,,2021年欧洲杯 ,,,,2021年欧洲杯 ,,,,2021年欧洲杯 ,,,,2021年欧洲杯 ,,,,2021年欧洲杯 ,,,,2021年欧洲杯
版本 1.10.0
在生物导体中 Bioc 3.10(R-3.6)(2。5年)
执照 GPL-3 +文件执照
要看 总结性特征
进口 方法,矩阵,,,,S4VECTORS,,,,延迟,,,,延迟的matrixstats,,,,生物脑,,,,生物比较,,,,生物兴奋,统计,utils,RCPP,,,,beachmat, 平行
链接 RCPP,,,,beachmat
建议 测试,,,,尼特,,,,rmarkDown,,,,生物使用,,,,生物基因,,,,Singlecellexperiment,,,,砍伐,,,,评分,,,,斯克兰,,,,scrnaseq,,,,GGPLOT2,,,,pheatmap,grdevices,栅格,,,,维里迪斯,,,,CellDex
系统要求 C ++ 11
增强
URL https://github.com/ltla/singler
BugReports https://support.bioconductor.org/
取决于我 奥斯卡。
进口我 Singlecelltk
建议我 tidysinglecellexperiment
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 Singler_1.10.0.tar.gz
Windows二进制 singler_1.10.0.zip
MacOS 10.13(高山脉) Singler_1.10.0.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/singler
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:包装/新人
包装短URL //www.andersvercelli.com/packages/singler/
软件包下载报告 下载统计

文档»

生物导体

r/克兰软件包和文档

支持»

请阅读发布指南。向以下位置之一发布有关生物导体的问题:

  • 支持网站- 有关生物处理套件的问题
  • Bioc-devel邮件列表 - 包装开发人员2021欧洲杯体育投注开户