Somaticsignatures.

DOI：10.18129 / b9.bioc.somaticsignatures.

体细胞签名

Biocometiond版本：释放（3.12）

Somaticsignatures包识别单核苷酸变体（SNV）的突变签名。它提供了与NIK-Zainal（2012，Cell）中描述的方法相关的基础设施，具有矩阵分解算法的灵活性。

作者：朱利安格林

维护者：朱利安Gehring

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“4.0”）并输入：

if（！percennamespace（“biocmanager”，squilly = true））install.packages（“biocmanager”）biocmanager ::安装（“somaticsignatures”）

对于旧版本，请参阅相应的生物导体释放。

文件

要查看系统中安装此包版本的文档，请启动r并输入：

Browsevignettes（“Somaticsignatures”）

HTML.	r script.	Somaticsignatures.
PDF.		参考手册
文本		消息
文本		执照

细节

Biocviews.	2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯
版本	2.26.0
在生物导体中以来	BIOC 2.14（R-3.1）（7年）
执照	mit +文件执照
依靠	r（> = 3.1.0），VariantAnnotation.那Genomicranges.那NMF.
进口	S4Vectors.那绞喉那genomeinfodb.那生物仪器那ggplot2.那GGBIO.那重塑2.那NMF.那pcamethods.那BioBase.， 方法，代理人
链接到
建议	testthat.那kn， 平行，bsgenome.hsapiens.1000Genomes.HS37D5那SomaticCencealterations那ggdendro那快餐那SVA.
系统要求
加强
URL.	https://github.com/juliangehring/somaticsignatures.
Bugreports.	https://support.biocumon.org.
取决于我
进口我	r那耶稣
建议我
链接给我
建立报告

包档案包

跟随2021年欧洲杯比分预测 在r会话中使用此包的说明。

源包	somaticsignatures_2.26.0.tar.gz.
Windows二进制文件	somaticsignatures_2.26.0.zip.
Macos 10.13（高塞拉）	somaticsignatures_2.26.0.tgz.
源存储库	git clone https://git.biocumon.org/packages/somaticsignatures.
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.biocondion.org：包/ somaticsignatures
包短网址	https://biocumon.org/packages/somaticsignatures//
包裹下载报告	下载统计信息