西班牙猎狗

doi:10.18129/b9.bioc.spaniel

空间转录组学分析

生物导体版本:版本(3.15)

西班牙猎犬包括一系列工具,以帮助质量控制和分析空间转录组学数据。西班牙猎狗可以从原始的空间转录组系统或10X森林技术中导入数据。该软件包包含功能来创建单链体验seurat对象,并提供了一种将组织学图像加载到R中的方法。SpanielPlot函数允许可视化S4对象中包含在组织图像上的S4对象中包含的指标。

作者:雷切尔·皇后[AUT,CRE]

维护者:Rachel Queen

引用(从r内,输入引用(“西班牙猎犬”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.2”)并输入:

if(!quired(“ Biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ Biocmanager”)Biocmanager :: install(“ Spaniel”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

Browsevignettes(“ Spaniel”)

html R脚本 西班牙猎狗10倍森林
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细节

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版本 1.10.0
在生物导体中 Bioc 3.10(R-3.6)(2。5年)
执照 麻省理工学院 +文件执照
要看 R(> = 4.0)
进口 Seurat,,,,Singlecellexperiment,,,,总结性特征,,,,dplyr, 方法,GGPLOT2,,,,评分(> = 1.13),斯克兰,,,,Igraph,,,,闪亮的,,,,jpeg,,,,马格里特,utils,S4VECTORS,,,,液滴,,,,jsonlite,,,,PNG
链接
建议 尼特,,,,rmarkDown,,,,测试,,,,DevTools
系统要求
增强
URL
取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 Spaniel_1.10.0.tar.gz
Windows二进制 Spaniel_1.10.0.zip
MacOS 10.13(高山脉) Spaniel_1.10.0.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/spaniel
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:包装/西班牙裔
包装短URL //www.andersvercelli.com/packages/spaniel/
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