structstrings.

DOI：10.18129 / b9.bioc.structstrings.

使用生物带的点支架注释的实现

Bioconductor版本：释放（3.13）

StructStrings包实现了广泛使用的点支架注释，用于在结构化RNA中存储基本配对信息。StructStrings使用BioStrings包提供的基础架构，并从BString类中派生DotBracketString和相关类。由此，可以为深度分析生产基对表。另外，可以检索基对的循环指数。为了更好的效率，信息转换是在C中实施的，激励到Viennarna包的大延伸。

作者：Felix上午ernst [aut，cre]

维护者：Felix上午ernst

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“4.1”）并输入：

if（！percennamespace（“biocmanager”，squilly = true））install.packages（“biocmanager”）biocmanager ::安装（“structstrings”）

对于旧版本，请参阅相应的生物导体释放。

文件

要查看系统中安装此包版本的文档，请启动r并输入：

BROWSEVIGNETTES（“StructStrings”）

HTML.	r script.	structstrings.
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文本		消息

细节

Biocviews.	2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯
版本	1.8.0.
在生物导体中以来	BIOC 3.9（R-3.6）（2年）
执照	艺术-2.0
依靠	r（> = 4.0），S4Vectors.（> = 0.27.12），绞喉（> = 2.23.9），生物仪器（> = 2.57.2）
进口	方法，生物根系那xvector.那stringr.那stringi.那蜡笔，grdevices.
链接到	绞喉那S4Vectors.
建议	testthat.那kn那RAMAMAMDOW.那Trnascanimport.那生物焦
系统要求
加强
URL.	https://github.com/felixernster/structionstrings.
Bugreports.	https://github.com/felixernster/structionstrings/issues.
取决于我	TRNA.那trnadbimport.
进口我	Trnascanimport.
建议我
链接给我
建立报告

包档案包

跟随2021年欧洲杯比分预测 在r会话中使用此包的说明。

源包	structstrings_1.8.0.tar.gz.
Windows二进制文件	structstrings_1.8.0.zip.
Macos 10.13（高塞拉）	structstrings_1.8.0.tgz.
源存储库	git clone https://git.biocumon.org/packages/structionstrings.
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.biocondion.org：包/ Structstrings
包短网址	https://biocumon.org/packages/structionstrings/
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