StrafturalVariantAnnotation.

DOI：10.18129 / b9.bioc.structuralvariantannotation

结构变体的变异注释

Bioconductor版本：释放（3.13）

StructionalVariantAnnotation包含有用的辅助功能，用于处理VCF格式中的结构变体。该软件包包含用于从多个流行呼叫者解析VCF的功能以及用于处理涉及两个单独基因组基因座编码为Granges对象的分断点的功能。

作者：Daniel Cameron [Aut，Cre]，毁了dong [aut]

维护者：Daniel Cameron

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“4.1”）并输入：

if（！perceneNameSpace（“biocmanager”，静静= true））install.packages（“biocmanager”）biocmanager ::安装（“structuralvariantannotation”）

对于旧版本，请参阅相应的生物导体释放。

文件

要查看系统中安装此包版本的文档，请启动r并输入：

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HTML.	r script.	结构变型注释包
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文本		消息

细节

Biocviews.	2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯
版本	1.8.0.
在生物导体中以来	BIOC 3.9（R-3.6）（2年）
执照	GPL-3
依靠	Genomicranges.那rtracklayer.那VariantAnnotation.那生物根系，r（> = 3.6.0）
进口	assertthat.那生物仪器那stringr.那dplyr.， 方法，rlang.
链接到
建议	bsgenome.hsapiens.ucsc.hg19.那ggplot2.那devtools.那testthat.那Roxygen2.那Covr.那kn那普利兰语那GGBIO.那Biovizbase.那盘旋那Tictoc那genomeinfodb.那绞喉那S4Vectors.那概括分析
系统要求
加强
URL.
取决于我
进口我
建议我
链接给我
建立报告

包档案包

跟随2021年欧洲杯比分预测 在r会话中使用此包的说明。

源包	structuralvariantannotation_1.8.0.tar.gz.
Windows二进制文件	structuralvariantannotation_1.8.0.zip.
Macos 10.13（高塞拉）	structuralvariantannotation_1.8.0.tgz.
源存储库	git clone https://git.biocumon.org/packages/strusturalVariantannotation.
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.biocondudard.org：包/结构性variantannotation
包短网址	https://biocumon.org/packages/structuralVariantannotation/
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