teqc

doi:10.18129/b9.bioc.teqc

目标捕获实验的质量控制

生物导体版本:版本(3.13)

目标捕获实验将基于杂交的基于杂交(在溶液或微阵列中)捕获和富集感兴趣的基因组区域(例如外显子组)与捕获的DNA片段的高吞吐量测序。该软件包提供了评估和可视化目标富集过程质量的功能,例如捕获的特异性和灵敏度,target读取覆盖范围等。

作者:M。Hummel,S。Bonnin,E。Lowy,G。Roma

维护者:莎拉·邦宁(Sarah Bonnin)

引用(从r内,输入引用(“ TEQC”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.1”)并输入:

if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ teqc”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

Browsevignettes(“ TEQC”)

PDF R脚本 teqc
PDF 参考手册
文本 消息

细节

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版本 4.14.0
在生物导体中 Bioc 2.8(R-2.13)(10年)
执照 GPL(> = 2)
要看 方法,生物基因(> = 0.1.0),iranges(> = 1.13.5),rsamtools,,,,HWRITER
进口 生物酶(> = 2.15.1)
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构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 teqc_4.14.0.tar.gz
Windows二进制 teqc_4.14.0.zip
MacOS 10.13(高山脉) teqc_4.14.0.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/teqc
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:packages/teqc
包装短URL //www.andersvercelli.com/packages/teqc/
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