- 家
- Biocumon 3.13
- 软件包
- tfea.chip.
tfea.chip.
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DOI：10.18129 / b9.bioc.tfea.chip.
分析转录因子富集
Bioconductor版本：释放（3.13）
用来自芯片-SEQ实验的数据进行分析在基因中的转录因子富集。
作者：Laura PuenteSantamaría，路易斯德尔比索
维护者：Laura PuenteSantamaría
引文（从R内，输入引文（“TFEA.CHIP”））：
安装
要安装此软件包，请启动R（版本“4.1”）并输入：
if（！percennamespace（“biocmanager”，squilly = true））install.packages（“biocmanager”）biocmanager ::安装（“tfea.chip”）
对于旧版本，请参阅相应的生物导体释放。
文件
要查看系统中安装此包版本的文档，请启动r并输入：
BROWSEVIGNETTES（“TFEA.CHIP”）
| HTML. | r script. | tfea.chip：转录因子浓缩的工具套件 |
| PDF. | 参考手册 | |
| 文本 | 消息 |
细节
| Biocviews. | 2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 |
| 版本 | 1.12.0 |
| 在生物导体中以来 | BIOC 3.7（R-3.5）（3年） |
| 执照 | 艺术-2.0 |
| 依靠 | r（> = 3.3） |
| 进口 | Genomicranges.那绞喉那生物雕那基因组法，grdevices，dplyr.，统计数据，utils，R.utils.， 方法，org.hs.eg.db. |
| 链接到 | |
| 建议 | kn那RAMAMAMDOW.那S4Vectors.那情节那秤那Tidyr.那ggplot2.那GSEABASE.那deseq2.那生物根系那GGRepel.那rcompanion那txdb.hsapiens.ucsc.hg19.knowngene. |
| 系统要求 | |
| 加强 | |
| URL. | |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 链接给我 | |
| 建立报告 |
包档案包
跟随2021年欧洲杯比分预测 在r会话中使用此包的说明。
| 源包 | tfea.chip_1.12.0.tar.gz. |
| Windows二进制文件 | tfea.chip_1.12.0.zip. |
| Macos 10.13（高塞拉） | tfea.chip_1.12.0.tgz. |
| 源存储库 | git clone https://git.biocumon.org/packages/tfea.chip. |
| 源存储库（开发人员访问） | git clone git@git.biocumon.org：包/ tfea.chip |
| 包短网址 | https://biocumon.org/packages/tfea.chip/ |
| 包裹下载报告 | 下载统计信息 |
