doi:10.18129/b9.bioc.tin

转录组不稳定性分析

生物导体版本:版本(3.15)

TIN软件包实现了一组基于外显子表达配置文件的转录组不稳定性分析工具。在剪接因子的背景下,研究了外显子使用情况,以分析与剪接因子表达相关的程度转录组不稳定性。在转录组不稳定性相关分析中,将数据与替代剪接分数的随机排列和随机基因集的表达进行比较。

作者:Bjarne Johannessen,Anita Sveen和Rolf I. Skotheim

维护者:bjarne johannessen

引用(从r内,输入引用(“锡”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.2”)并输入:

if(!quired(“ Biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ Biocmanager”)Biocmanager :: install(“ Tin”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

Browsevignettes(“锡”)

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版本 1.28.0
在生物导体中 Bioc 3.1(R-3.2)(7年)
执照 艺术2.0
要看 r(> = 2.12.0),Data.Table,,,,,,,,香气
进口 WGCNA,,,,壁球,,,,Stringr
链接
建议 尼特,,,,香气,,,,affxparser,,,,运行,,,,生物基因
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源包 tin_1.28.0.tar.gz
Windows二进制 tin_1.28.0.zip
MacOS 10.13(高山脉) tin_1.28.0.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/tin
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:包装/锡
包装短URL //www.andersvercelli.com/packages/tin/
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