吐司

doi:10.18129/b9.bioc.toast

分析异质组织的工具

生物导体版本:版本(3.15)

该软件包致力于分析复杂组织中的高通量数据(例如基因表达微阵列,DNA甲基化微阵列,RNA-SEQ)。当前功能包括1.检测细胞类型的特异性或跨细胞类型差异信号2.基于树的差分分析3.改善无参考反卷积的可变选择4.与先验知识的部分无参考反卷积。

作者:Ziyi Li和Weiwei Zhang和Luxiao Chen和Hao Wu

维护者:ziyi li

引用(从r内,输入引用(“吐司”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.2”)并输入:

if(!quired(“ Biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ Biocmanager”)Biocmanager :: install(“ Toast”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

browsevignettes(“吐司”)

html R脚本 Toast用户指南
PDF 参考手册
文本 消息

细节

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版本 1.10.1
在生物导体中 Bioc 3.10(R-3.6)(3年)
执照 GPL-2
要看 r(> = 3.6),繁殖,,,,林玛,,,,nnls,,,,Quadprog
进口 统计,方法,总结性特征,,,,公司,,,,多帕尔, 平行,GGPLOT2,,,,花花公子,,,,ggally
链接
建议 生物使用,,,,尼特,,,,rmarkDown,,,,GPLOTS,,,,矩阵,,,,矩阵
系统要求
增强
URL
BugReports https://github.com/ziyili20/toast/issues
取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 toast_1.10.1.tar.gz
Windows二进制 toast_1.10.1.zip
MacOS 10.13(高山脉) toast_1.10.1.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/toast
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:包装/吐司
包装短URL //www.andersvercelli.com/packages/toast/
软件包下载报告 下载统计
Bioc 3.15的旧源软件包 来源存档

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