TrajectoryUtils

DOI:10.18129 / B9.bioc.TrajectoryUtils

单细胞轨迹分析工具

Bioconductor版本:发布(3.15)

为单细胞轨迹分析实现低级实用程序，主要用于在高级包中重用。包括一个函数来创建集群级最小生成树和数据结构，以保存伪时间推断结果。

作者:Aaron Lun [aut, cre]， Kelly Street [aut]

维护者:Aaron Lun

安装

要安装这个包，启动R(版本"4.2")并输入:

如果(!require("BiocManager"，悄然= TRUE)) install.packages("BiocManager") BiocManager::install("TrajectoryUtils")

对于旧版本的R，请参考相应的Bioconductor释放。

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档，启动R并输入:

browseVignettes(“TrajectoryUtils”)

超文本标记语言	R脚本	轨迹公用事业
PDF		参考手册

细节

biocViews	2021年欧洲杯 ，2021年欧洲杯 ，2021年欧洲杯
版本	1.4.0
在Bioconductor中	BioC 3.13 (R-4.1)(1年)
许可证	GPL-3
取决于	SingleCellExperiment
进口	方法、统计数据矩阵，igraph，S4Vectors，SummarizedExperiment
链接
建议	BiocNeighbors，DelayedArray，DelayedMatrixStats，BiocParallel，testthat，knitr，BiocStyle，rmarkdown
SystemRequirements
增强了
URL	//www.andersvercelli.com/packages/TrajectoryUtils
BugReports	https://github.com/LTLA/TrajectoryUtils/issues
这取决于我	弹弓，TSCAN
进口我	调味品，singleCellTK，tradeSeq
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在您的R会话中使用此包的说明。

源包	TrajectoryUtils_1.4.0.tar.gz
Windows二进制	TrajectoryUtils_1.4.0.zip
macOS 10.13 (High Sierra)	TrajectoryUtils_1.4.0.tgz
源库	git clone https://git.bioconductor.org/packages/TrajectoryUtils
源存储库(开发人员访问)	git clone git@git.bioconductor.org:packages/TrajectoryUtils
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/TrajectoryUtils/
软件包下载报告	下载数据