TreeSummarizedExperiment

DOI:10.18129 / B9.bioc.TreeSummarizedExperiment

树总结实验:一个关于树结构数据的S4类

Bioconductor版本:发行版(3.13)

treesummarizeexperiment扩展了singlecellexperexperiment，以包含矩形数据的行或列上的层次信息。

作者:黄瑞珠[aut, cre]，菲利克斯·恩斯特[ctb]

维护人员:黄瑞珠

安装

要安装此包，启动R(版本“4.1”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")

对于较老版本的R，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请从R开始并输入:

browseVignettes(“TreeSummarizedExperiment”)

超文本标记语言	R脚本	1.介绍TreeSE
超文本标记语言	R脚本	2.结合的传染性海绵状脑病
PDF		参考手册

细节

biocViews	2021年欧洲杯 ，2021年欧洲杯 ，2021年欧洲杯
版本	2.0.2
Bioconductor自	BioC 3.9 (R-3.6)(2年)
许可证	GPL (> = 2)
取决于	R (> = 3.6.0),SingleCellExperiment，S4Vectors(> = 0.23.18),Biostrings
进口	方法,BiocGenerics跑龙套,猿，rlang，dplyr，SummarizedExperiment，BiocParallel，IRanges，treeio
链接
建议	ggtree，ggplot2，BiocStyle，knitr，rmarkdown，testthat
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我	curatedMetagenomicData，ExperimentSubset，米娅，miaViz，microbiomeDataSets
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用这个包的说明。

源包	TreeSummarizedExperiment_2.0.2.tar.gz
Windows二进制	TreeSummarizedExperiment_2.0.2.zip
macOS 10.13 (High Sierra)	TreeSummarizedExperiment_2.0.2.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/TreeSummarizedExperiment
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ TreeSummarizedExperiment
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/TreeSummarizedExperiment/
包下载报告	下载数据
bioc3.13的旧源包	源存档