vcfarray

doi：10.18129/b9.bioc.vcfarray

将磁盘 /远程VCF文件表示为类似数组的对象

生物导体版本：版本（3.13）

VCFARRAY扩展了延迟段，以将VCF数据输入表示为类似数组的对象，并将其作为后端 /远程VCF文件作为后端。可以将VCF文件的数据输入（包括信息字段，格式字段）和固定列（参考，Alt，Qual，过滤器）转换为具有不同维度的VCFARRAY实例。

作者：刘Qian [AUT，CRE]，Martin Morgan [AUT]

维护者：Qian liu

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.1”）并输入：

if（！sireseenamespace（“ biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ biocmanager”）biocmanager :: install（“ vcfarray”）

对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：

browsevignettes（“ vcfarray”）

html	R脚本	VCFARRAY：带有磁盘/远程VCF后端的延迟段对象
PDF		参考手册
文本		消息

细节

生物浏览	2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯
版本	1.8.0
在生物导体中	Bioc 3.9（R-3.6）（2年）
执照	GPL-3
要看	R（> = 3.6），方法，生物基因，，，，延迟（> = 0.7.28）
进口	工具，基因组机，，，，变体（> = 1.29.3），Genomicfiles（> = 1.17.3），S4VECTORS（> = 0.19.19），rsamtools
链接
建议	Seqarray，，，，生物使用，，，，生物管理器，，，，测试，，，，尼特，，，，rmarkDown
系统要求
增强
URL	https://github.com/liubuntu/vcfarray
BugReports	https://github.com/liubuntu/vcfarray/issues
取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包	vcfarray_1.8.0.tar.gz
Windows二进制	vcfarray_1.8.0.zip（32-和64位）
MacOS 10.13（高山脉）	vcfarray_1.8.0.tgz
源存储库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/vcfarray
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.bioconductor.org：packages/vcfarray
包装短URL	//www.andersvercelli.com/packages/vcfarray/
软件包下载报告	下载统计