vasp

doi:10.18129/b9.bioc.vasp

量化和可视化种群剪接变化

生物导体版本:版本(3.15)

从简短的RNA-seq数据和基因剪接信息的可视化信息中发现全基因组可变的替代剪接事件,用于出版物中的出版物质量 - 多面板数字。(警告:由于所取代的寿司弃用寿司,可视化功能被删除。如果要使用它,请更改回旧版本。)

作者:huihui yu [aut,cre],Qian du [aut],Chi Zhang [aut]

维护者:foxmail.com上的huihui yu

引用(从r内,输入引用(“ VASP”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.2”)并输入:

if(!quired(“ Biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ Biocmanager”)Biocmanager :: install(“ VASP”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

Browsevignettes(“ VASP”)

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细节

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版本 1.8.0
在生物导体中 Bioc 3.12(R-4.0)(1。5年)
执照 GPL(> = 2.0)
要看 r(> = 4.0),舞会礼服
进口 iranges,,,,基因组机,,,,S4VECTORS, 平行,矩阵,,,,基因组签名,,,,GenomeInfodB,,,,rsamtools,,,,,统计,图形,方法
链接
建议 尼特,,,,rmarkDown
系统要求
增强
URL https://github.com/yuhuihui2011/vasp
BugReports https://github.com/yuhuihui2011/vasp/issues
取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 vasp_1.8.0.tar.gz
Windows二进制 VASP_1.8.0.ZIP(仅64位)
MacOS 10.13(高山脉) vasp_1.8.0.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/vasp
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:packages/vasp
包装短URL //www.andersvercelli.com/packages/vasp/
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