香草

DOI：10.18129 / b9.bioc.vanillaice.

用于高吞吐学基因分型阵列的隐马尔可夫模型

Bioconductor版本：释放（3.13）

隐马尔可夫模型用于表征高通量SNP阵列中的染色体改变。

作者：Robert Scharpf [Aut，CRE]

维护者：罗伯特Scharpf

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“4.1”）并输入：

if（！procenameSpace（“biocmanager”，静静= true））install.packages（“biocmanager”）biocmanager ::安装（“vanillaice”）

对于旧版本，请参阅相应的生物导体释放。

文件

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Browsevignettes（“香草”）

PDF.	r script.	crlmmdownstream.
PDF.	r script.	香草小插图
PDF.		参考手册
文本		消息

细节

Biocviews.	2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯
版本	1.54.0
在生物导体中以来	BIOC 2.1（R-2.6）（13.5岁）
执照	LGPL-2
依靠	r（> = 3.5.0），生物根系（> = 0.13.6），Genomicranges.（> = 1.27.6），概括分析（> = 1.5.3）
进口	MatrixGenerics.那BioBase.那S4Vectors.（> = 0.23.18），绞喉（> = 1.14.0），oligoclasses.（> = 1.31.1），Foreach.那MatrixStats.那data.table.， 网格，格子， 方法，Genomeinfodb.（> = 1.11.4），CRLMM.，工具，统计数据，utils，bsgenome.hsapiens.ucsc.hg18
链接到
建议	运行那human610quadv1bcrlmm.
系统要求
加强	domc.那dompi.那Dosnow.那多达齐全，无聊
URL.
取决于我	最小值
进口我
建议我	oligoclasses.
链接给我
建立报告

包档案包

跟随2021年欧洲杯比分预测 在r会话中使用此包的说明。

源包	vanillaice_1.54.0.tar.gz.
Windows二进制文件	vanillaice_1.54.0.zip.
Macos 10.13（高塞拉）	Vanillaice_1.54.0.tgz.
源存储库	git clone https://git.biocumon.org/packages/vanillaice.
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.biocondudard.org：包裹/香毒
包短网址	https://biocumon.org/packages/vanillaice/
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