vplotr

doi:10.18129/b9.bioc.vplotr

制作V图和计算足迹配置文件的一组工具

生物导体版本:版本(3.13)

消化和保护DNA核酸酶的模式,例如DNase I,微球菌核酸酶和TN5转座酶可用于推断相关蛋白的位置。该软件包包含有用的功能来分析配对末端测序片段密度的模式。VPLOTR促进了对单个或聚集的基因组基因座的V-图和足迹轮廓的产生。

作者:Jacques Serizay [AUT,CRE]

维护者:jacques serizay

引用(从r内,输入引用(“ vplotr”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.1”)并输入:

if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ vplotr”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

browsevignettes(“ vplotr”)

html R脚本 vplotr
PDF 参考手册
文本 消息

细节

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版本 1.2.0
在生物导体中 Bioc 3.12(R-4.0)(0.5岁)
执照 GPL-3
要看 r(> = 4.0),基因组机,,,,iranges,,,,GGPLOT2
进口 牛仔图,,,,马格里特,,,,GenomeInfodB,,,,基因组签名,,,,rcolorbrewer,,,,动物园,,,,rsamtools,,,,S4VECTORS, 平行,RESHAPE2,方法,图形,统计
链接
建议 GenomicFeatures,,,,txdb.scerevisiae.ucsc.saccer3.sgdgene,,,,测试,,,,COVR,,,,尼特,,,,rmarkDown,,,,pkgdown
系统要求
增强
URL https://github.com/js2264/vplotr
BugReports https://github.com/js2264/vplotr/issues
取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 vplotr_1.2.0.tar.gz
Windows二进制 vplotr_1.2.0.zip
MacOS 10.13(高山脉) vplotr_1.2.0.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/vplotr
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:packages/vplotr
包装短URL //www.andersvercelli.com/packages/vplotr/
软件包下载报告 下载统计
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  • Bioc-devel邮件列表 - 包装开发人员2021欧洲杯体育投注开户