XINA

DOI:10.18129 / B9.bioc.XINA

基于多重等压质量标记的动力学数据网络分析

Bioconductor版本:发行版(3.16)

XINA的目的是确定哪些蛋白质在实验条件内和跨实验条件下表现出相似的模式,因为具有共丰度模式的蛋白质可能具有共同的分子功能。XINA导入多个数据集,在硅片上标记数据集,并将数据组合成多个集群进行后续的子分组。结果是一个单一的输出,描述了所有条件下的变化。XINA不仅提取了实验内部和实验之间的丰度曲线,还整合了蛋白质-蛋白质相互作用数据库和KEGG等综合资源,分别推断相互作用者和分子函数,并产生直观的图形输出。

作者:Lang Ho Lee 和Sasha A. Singh < sasingat bwh.harvard.edu>

维护者:Lang Ho Lee 和Sasha A. Singh < sasingat bwh.harvard.edu>

引文(从R内,输入引用(“XINA”)):

安装

要安装这个包,启动R(版本“4.2”)并输入:

如果(!require("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")

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文档

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browseVignettes(“XINA”)

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版本 1.16.0
在Bioconductor BioC 3.8 (R-3.5)(4.5年)
许可证 GPL-3
取决于 R (>= 3.5)
进口 mclustplyr冲积ggplot2igraphgridExtra,工具,grDevices,图形,utils,STRINGdb
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源包 XINA_1.16.0.tar.gz
Windows二进制 XINA_1.16.0.zip
macOS二进制文件(x86_64) XINA_1.16.0.tgz
macOS二进制文件(arm64) XINA_1.16.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/XINA
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:packages/XINA
生物包浏览器 https://code.bioconductor.org/browse/XINA/
包短Url //www.andersvercelli.com/packages/XINA/
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