Bioconductor版本:发行版(3.16)
XINA的目的是确定哪些蛋白质在实验条件内和跨实验条件下表现出相似的模式,因为具有共丰度模式的蛋白质可能具有共同的分子功能。XINA导入多个数据集,在硅片上标记数据集,并将数据组合成多个集群进行后续的子分组。结果是一个单一的输出,描述了所有条件下的变化。XINA不仅提取了实验内部和实验之间的丰度曲线,还整合了蛋白质-蛋白质相互作用数据库和KEGG等综合资源,分别推断相互作用者和分子函数,并产生直观的图形输出。
作者:Lang Ho Lee
维护者:Lang Ho Lee
引文(从R内,输入引用(“XINA”)
):
要安装这个包,启动R(版本“4.2”)并输入:
如果(!require("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")
对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放.
要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:
browseVignettes(“XINA”)
超文本标记语言 | R脚本 | xina_user_code |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | 2021年欧洲杯 ,2021年欧洲杯 ,2021年欧洲杯 ,2021年欧洲杯 ,2021年欧洲杯 |
版本 | 1.16.0 |
在Bioconductor | BioC 3.8 (R-3.5)(4.5年) |
许可证 | GPL-3 |
取决于 | R (>= 3.5) |
进口 | mclust,plyr,冲积,ggplot2,igraph,gridExtra,工具,grDevices,图形,utils,STRINGdb |
链接 | |
建议 | knitr,rmarkdown |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
全靠我 | |
进口我 | |
建议我 | |
链接到我 | |
构建报告 |
遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。
源包 | XINA_1.16.0.tar.gz |
Windows二进制 | XINA_1.16.0.zip |
macOS二进制文件(x86_64) | XINA_1.16.0.tgz |
macOS二进制文件(arm64) | XINA_1.16.0.tgz |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/XINA |
源存储库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:packages/XINA |
生物包浏览器 | https://code.bioconductor.org/browse/XINA/ |
包短Url | //www.andersvercelli.com/packages/XINA/ |
软件包下载报告 | 下载数据 |
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