骨料

doi：10.18129/b9.bioc.ggregatebiovar

多受试者SCRNA-SEQ的差异基因表达分析

生物导体版本：版本（3.15）

对于从多个受试者收集的单细胞RNA-seq数据（例如生物样品或技术重复），该软件包包含了在受试者水平上汇总单细胞基因表达谱的工具。单链球对象被视为输入，并将其转换为摘要的experiment对象列表，其中每个列表元素对应于分配的单元格类型。汇总的表面对象包含汇总基因基因计数矩阵和单个受试者的受试者间列元元素，这些矩阵可以使用下游散装RNA-seq工具进行处理。

作者：Jason Ratcliff [AUT，CRE]，Andrew Thurman [AUT]，Michael Chimenti [CTB]，Alejandro Pezzulo [CTB]

维护者：uiowa.edu>的Jason Ratcliff

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.2”）并输入：

if（！quired（“ Biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ Biocmanager”）Biocmanager :: install（“ gengregateBiovar”）

对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：

browsevignettes（“ ExcregateBiovar”）

html	R脚本	多主体SCRNA-SEQ分析
PDF		参考手册
文本		消息

细节

生物浏览	2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯
版本	1.6.0
在生物导体中	Bioc 3.12（R-4.0）（1。5年）
执照	GPL-3
要看	R（> = 4.0）
进口	统计，方法，S4VECTORS，，，，总结性特征，，，，Singlecellexperiment，，，，矩阵，，，，蒂布尔，，，，rlang
链接
建议	生物使用，，，，魔术，，，，尼特，，，，rmarkDown，，，，测试，，，，生物基因，，，，deseq2，，，，马格里特，，，，dplyr，，，，GGPLOT2，，，，牛仔图，，，，ggtext，，，，rcolorbrewer，，，，pheatmap，，，，维里迪斯
系统要求
增强
URL	https://github.com/jasonratcliff/aggregatebiovar
BugReports	https://github.com/jasonratcliff/aggregatebiovar/issues
取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包	engregatebiovar_1.6.0.tar.gz
Windows二进制	engregateBiovar_1.6.0.zip
MacOS 10.13（高山脉）	engregatebiovar_1.6.0.tgz
源存储库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/aggregatebiovar
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.bioconductor.org：packages/grockregatebiovar
包装短URL	//www.andersvercelli.com/packages/aggregatebiovar/
软件包下载报告	下载统计