注释

DOI:10.18129 / B9.bioc.annotate

注释的微阵列

Biocometiond版本:释放(3.12)

使用R环境进行注释。

作者:r.绅士

Maintainer: Bioconductor Package Maintainer < Maintainer,请登录bioconductor.org>

引用(从R中,输入引用(“注释”)):

安装

要安装这个包,启动R(版本为“4.0”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") BiocManager::install("annotate")

对于旧版本的R,请参阅适当的Bioconductor释放

文档

要查看系统中安装的这个包的版本文档,启动R并输入:

browseVignettes(“注释”)

PDF R脚本 注释概述
PDF R脚本 基本去使用
PDF R脚本 获取HTML输出
PDF R脚本 如何使用染色体信息
PDF R脚本 如何使用:使用在线查询工具
PDF R脚本 使用Affymetrix探测电平数据
PDF R脚本 使用数据包
PDF R脚本 使用同源包
PDF 参考手册
文本 消息

细节

biocViews 2021年欧洲杯 ,2021年欧洲杯 ,2021年欧洲杯 ,2021年欧洲杯
版本 1.68.0
Bioconductor自 BIOC 1.6(R-2.1)或更早版本(> 15.5岁)
许可证 艺术- 2.0
取决于 R (> = 2.10),AnnotationDbi(> = 1.27.5),XML.
进口 BioBase.,DBI.,xtable,图形,utils,统计,方法,BiocGenerics(> = 0.13.8),httr
链接
建议 hgu95av2.db,genefilter,Biostrings(> = 2.25.10),绞喉,Rae230a.db.,rae230aprobe,tkWidgets,go.db.,org.Hs.eg.db,org.Mm.eg.db,hom.Hs.inp.db,孵化器,Rgraphviz,RUnit
系统要求
增强了
URL
取决于我 ChromheatMap.,GeneAnswers,Geneplotter.,GOSim,GSEABASE.,Idiogram.,马特,MGFM.,雷尼卡,MLInterfaces,Neve2006,PCpheno,现象,PREDA,PREDAsampledata,RpsiXML,sampleclassifier,scisi.,SemDist
进口我 咖啡馆,类别,CompoundationCompare.,cn,Codelink.,debrowser,DrugVsDisease,GeneAnswers,genefilter,GlobalAncova,globaltest,GOstats,光民,methyAnalysis,弥撒,MGFR.,PathwaySplice,现象,qpgraph,ReportingTools,scisi.,systemPipeR,tigre,UMI4Cats
建议我 Adme16cod.db.,ag.db,ath1121501.db,Bioccasestudies.,BiocGenerics,biomaRt,bovine.db,canine.db,canine2.db,celegans.db,Chicken.DB.,clariomdhumanprobeset.db,clariomdhumantranscriptcluster.db,clariomshumanhttranscriptcluster.db,clariomshumantranscriptcluster.db.,clariomsmousehttranscriptcluster.db.,clariomsmousetranscriptcluster.db,clariomsrathttranscriptcluster.db,clariomsrattranscriptcluster.db.,drosgenome1.db,果蝇2.db.,ecoli2.db,Genomicranges.,GGHumanMethCancerPanelv1.db,GSAR,GSEALM,h10kcod.db.,h20kcod.db,hcg110.db,hgfocus.db.,hgu133a.db.,hgu133a2.db.,hgu133b.db,hgu133plus2.db,hgu219.db.,hgu95a.db,hgu95av2.db,hgu95b.db,hgu95c.db,hgu95d.db,hgu95e.db,hguatlas13k.db,hgubeta7.db,hgudkfz31.db.,hgug4100a.db,hgug4101a.db,hgug4110b.db,hgug4111a.db.,hgug4112a.db.,hgug4845a.db,hguqiagenv3.db,hi16cod.db,hmdbQuery,hs25kresogen.db,Hs6UG171.db,HsAgilentDesign026652.db,hta20probeset.db.,hta20transcriptcluster.db,hthgu133a.db,hthgu133b.db,hu35ksuba.db,hu35ksubb.db.,hu35ksubc.db.,hu35ksubd.db.,hu6800.db.,huex10stprobeset.db,huex10sttranscriptcluster.db,hugene10stprobeset.db.,hugene10sttranscriptcluster.db,hugene11stprobeset.db.,hugene11sttranscriptcluster.db,hugene20stprobeset.db.,hugene20sttranscriptcluster.db,hugene21stprobeset.db,hugene21sttranscriptcluster.db.,HuO22.db,hwgcod.db,Illuminahumanmethylation27k.db.,illuminaHumanv1.db,illuminaHumanv2.db,illuminaHumanv2BeadID.db,illuminaHumanv3.db,illuminaHumanv4.db,illuminaHumanWGDASLv3.db,illuminaHumanWGDASLv4.db,Illuminamousev1.db.,Illuminamousev1p1p1.db.,illuminaMousev2.db,illuminaRatv1.db,Indac.DB.,JazaeriMetaData.db,lapointe.db.,lumiHumanAll.db,lumiMouseAll.db,lumiratall.db.,m10kcod.db,m20kcod.db,maigesPack,MetagenomeSQ.,mgu74a.db,mgu74av2.db.,mgu74b.db,mgu74bv2.db,mgu74c.db.,mgu74cv2.db.,mguatlas5k.db,mgug4104a.db,mgug4120a.db.,mgug4121a.db.,mgug4122a.db,mi16cod.db,miRBaseVersions.db,中长期规划,mm24kresogen.db.,MmAgilentDesign026655.db,moe430a.db,moe430b.db.,moex10stprobeset.db.,moex10sttranscriptcluster.db,mogene10stprobeset.db,mogene10sttranscriptcluster.db.,mogene11stprobeset.db,mogene11sttranscriptcluster.db,mogene20stprobeset.db,mogene20sttranscriptcluster.db,mogene21stprobeset.db,mogene21sttranscriptcluster.db,mouse4302.db.,mouse430a2.db.,mpedbarray.db,mta10probeset.db.,mta10transcript cluster.db.,mu11ksuba.db,mu11ksubb.db,Mu15v1.db,mu19ksuba.db,mu19ksubb.db.,mu19ksubc.db.,mu22v3.db.,mwgcod.db,Norway981.db,nugohs1a520180.db.,nugomm1a520177.db,OperonHumanV3.db,org.ag.eg.db.,org.At.tair.db,org.Bt.eg.db,org.Ce.eg.db,org.Cf.eg.db,org.Dm.eg.db,org.dr.eg.db.,org.EcK12.eg.db,org.ecsakai.eg.db.,org.Gg.eg.db,org.Hs.eg.db,org.Mm.eg.db,org.Mmu.eg.db,org.pf.plasmo.db.,org.Pt.eg.db,org.Rn.eg.db,org.sc.sgd.db.,org.ss.eg.db.,org.Xl.eg.db,网页排名,PartheenMetaData.db,pcxn,pedbarrayv10.db,pedbarrayv9.db,pocrcannotation.db.,porcine.db.,彪马,r10kcod.db,Rae230a.db.,rae230b.db,raex10stprobeset.db,raex10sttranscriptcluster.db,ragene10stprobeset.db,ragene10sttranscriptcluster.db.,ragene11stprobeset.db.,ragene11sttranscriptcluster.db,ragene20stprobeset.db,ragene20sttranscriptcluster.db,ragene21stprobeset.db,ragene21sttranscriptcluster.db,rat2302.db,rgu34a.db,rgu34b.db,rgu34c.db,rguatlas4k.db,rgug4105a.db,rgug4130a.db.,rgug4131a.db,ri16cod.db,RnAgilentDesign028282.db,RnBeads,rnu34.db,Roberts2005Annotation.db,RTA10Probeset.dB.,rta10transcriptcluster.db,rtu34.db,rwgcod.db,SHDZ.db,siggenes.,SummarizedExperiment,u133x3p.db,xlaevis.db,yeast2.db,ygs98.db,Zebrafish.DB.
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包档案

遵循安装在你的R会话中使用这个包的说明。

源包 annotate_1.68.0.tar.gz
Windows二进制 annotate_1.68.0.zip
Macos 10.13(高塞拉) annotate_1.68.0.tgz
源库 git clone https://git.biocumon.org/packages/annotate.
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包/注释
包短网址 //www.andersvercelli.com/packages/annotate/
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