anota2seq

doi：10.18129/b9.bioc.anota2seq

通常使用Anota2Seq对翻译效率的全转录组分析通常适用

生物导体版本：版本（3.12）

ANOTA2SEQ提供了通过RNA测序或DNA-微阵列量化的多聚糖促进和核糖体促进研究（两个或多个样本类）的翻译效率和差异表达分析。多核体和核糖体促进通常会生成两个RNA源的数据；翻译mRNA和总mRNA。差异表达的分析用于估计每个RNA源内的变化（即翻译的mRNA或总mRNA）。转化效率的分析旨在确定转化效率的变化，导致蛋白质水平改变，这些蛋白质水平与总mRNA水平无关（即转化的mRNA的变化，与总mRNA的水平无关）或缓冲，这是一种调节转化效率的机制，以便蛋白质水平尽管总mRNA水平波动，但仍保持恒定（即，与翻译mRNA水平无关的总mRNA变化）。ANOTA2SEQ应用了部分方差和随机方差模型的分析来完成这些任务。

作者：克里斯蒂安·奥尔特林

维护者：克里斯蒂安·奥尔特林（Christian Oertlin

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.0”）并输入：

if（！sireseenamespace（“ biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ biocmanager”）biocmanager :: install（“ anota2seq”）

对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：

browsevignettes（“ anota2seq”）

PDF	R脚本	通常使用Anota2Seq对翻译效率的全转录组分析通常适用
PDF		参考手册
文本		消息

细节

生物浏览	2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯
版本	1.12.0
在生物导体中	Bioc 3.6（R-3.4）（3.5岁）
执照	GPL-3
要看	R（> = 3.4.0），方法
进口	多检验，，，，QVALUE，，，，林玛，，，，deseq2，，，，EDGER，，，，rcolorbrewer，grdevices，图形，统计，utils，总结性特征
链接
建议	生物使用，，，，尼特
系统要求
增强
URL
取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包	anota2seq_1.12.0.tar.gz
Windows二进制	anota2seq_1.12.0.zip
MacOS 10.13（高山脉）	anota2Seq_1.12.0.tgz
源存储库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/anota2seq
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.bioconductor.org：packages/anota2seq
包装短URL	//www.andersvercelli.com/packages/anota2seq/
软件包下载报告	下载统计