舞会礼服

DOI:10.18129 / B9.bioc.ballgown

灵活的，isoform-level差异表达分析

生物导体版本:发布(3.12)

汇编转录组的统计分析工具，包括灵活的差异表达分析，转录组结构的可视化，以及汇编转录组与注释的匹配。

作者:Jack Fu [aut]， Alyssa C. Frazee [aut, cre]， Leonardo Collado-Torres [aut]， Andrew E. Jaffe [aut]， Jeffrey T. Leek [aut, ths]

维护者:Jack Fu

安装

要安装此包，请启动R(版本“4.0”)并输入:

如果(!require ("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") BiocManager::install("ballgown")

有关较旧版本的R，请参阅适当的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的软件包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“舞会礼服”)

超文本标记语言	R脚本	灵活的异构水平差异表达分析与ball长袍
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文本		新闻

细节

biocViews	2021年欧洲杯 ，2021年欧洲杯 ，2021年欧洲杯 ，2021年欧洲杯 ，2021年欧洲杯 ，2021年欧洲杯
版本	2.22.0
Bioconductor自	BioC 3.0 (R-3.1)(6.5年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	R(>= 3.1.1)，方法
进口	GenomicRanges(> = 1.17.25),IRanges(> = 1.99.22),S4Vectors(> = 0.9.39),RColorBrewer样条函数,股东价值分析，limma，rtracklayer(> = 1.29.25),Biobase(> = 2.25.0),GenomeInfoDb
链接
建议	testthat，knitr
SystemRequirements
增强了
URL
BugReports	https://github.com/alyssafrazee/ballgown/issues
取决于我	vasp
进口我	RNASeqR
建议我	聚酯，variancePartition
我的链接
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用这个包的说明。

源包	ballgown_2.22.0.tar.gz
Windows二进制	ballgown_2.22.0.zip(32位和64位)
macOS 10.13 (High Sierra)	ballgown_2.22.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/ballgown
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/舞会礼服
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/ballgown/
包下载报告	下载数据