BiomFormat

DOI：10.18129 / b9.bioc.biomformat

用于BIOM文件格式的接口包

Bioconductor版本：释放（3.13）

这是用于与BIOM格式接口的R包。此包包括用于读取BIOM格式文件的基本工具，从BIOM对象（比单个表更复杂）以及将BIOM-Object写回BIOM格式文件的有限支持。此API的设计旨在匹配BIOM格式项目中包含的Python API和其他工具，但具有应熟悉R用户的“R味道”。这包括S4类和方法，以及共同核心功能/方法的扩展。

作者：Paul J. McMurdie 和Joseph N Paulson

维护者：Paul J. McMurdie

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“4.1”）并输入：

if（！procenamespace（“biocmanager”，squilly = true））install.packages（“biocmanager”）biocmanager ::安装（“biomformat”）

对于旧版本，请参阅相应的生物导体释放。

文件

要查看系统中安装此包版本的文档，请启动r并输入：

BROWSEVIGNETTES（“BIOMFormat”）

HTML.	r script.	生物形态包装小插图
PDF.		参考手册
文本		消息

细节

Biocviews.	2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯
版本	1.20.0
在生物导体中以来	BIOC 3.3（R-3.3）（5年）
执照	GPL-2
依靠	r（> = 3.2），方法
进口	普利尔（> = 1.8），雅思石（> = 0.9.16），矩阵（> = 1.2），RHDF5.
链接到
建议	testthat.（> = 0.10），kn（> = 1.10），生物焦（> = 1.6），RAMAMAMDOW.（> = 0.7）
系统要求
加强
URL.	https://github.com/joey711/biomformat/http://biom-format.org/
Bugreports.	https://github.com/joey711/biomformat/issues.
取决于我
进口我	蚕豆那microbiomeexplorer.那文学
建议我	MetagenomeSQ.那米娅那微生物积分
链接给我
建立报告

包档案包

跟随2021年欧洲杯比分预测 在r会话中使用此包的说明。

源包	BioMFormat_1.20.0.tar.gz.
Windows二进制文件	BioMformat_1.20.0.zip.
Macos 10.13（高塞拉）	BioMFormat_1.20.0.0.TGZ.
源存储库	git clone https://git.biocumon.org/packages/biomformat.
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.biocondudard.org：包装/生物形象
包短网址	https://biocumon.org/packages/biomformat//
包裹下载报告	下载统计信息