生物系列者

DOI:10.18129 / b9.bioc.biosigner.

从OMICS数据签名发现

Bioconductor版本:释放(3.13)

特征选择对于OMICS数据分析至关重要,以从复杂和高维数据中提取受限制和有意义的分子签名,并构建鲁棒分类器。此包实现了一种新方法,以评估分类器预测性能的变量的相关性。该方法可以与PLS-DA,随机林和SVM二进制分类器并行运行。返回签名和相应的“受限”模型,在新数据集中启用未来的预测。Workflow4metabolomics.org在线基础架构中提供了包裹的Galaxy实现,用于计算代谢组。

作者:Philippe Rinaudo ,Etienne venvenot

维护者:Philippe Rinaudo ,Etienne venvenot

引文(从R内,输入引文(“生物宣注者”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“4.1”)并输入:

if(!quancenamespace(“biocmanager”,squilly = true))install.packages(“biocmanager”)biocmanager :: install(“生物信号器”)

对于旧版本,请参阅相应的生物导体释放

文件

要查看系统中安装此包版本的文档,请启动r并输入:

BROWSEVIGNETTES(“生物协商者”)

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Biocviews. 2021年欧洲杯 2021年欧洲杯 2021年欧洲杯 2021年欧洲杯 2021年欧洲杯 2021年欧洲杯 2021年欧洲杯
版本 1.20.0
在生物导体中以来 BIOC 3.3(R-3.3)(5年)
执照 凯克
依靠 BioBase.罗尔斯
进口 方法,E1071.多atAdataset.随机林
链接到
建议 生物克生物根系生物焦golubesets.hu6800.db.knOMICADE4.RAMAMAMDOW.testthat.
系统要求
加强
URL.
取决于我
进口我 多态石
建议我
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包档案包

跟随2021年欧洲杯比分预测 在r会话中使用此包的说明。

源包 biosigner_1.20.0.tar.gz.
Windows二进制文件 biosigner_1.20.0.zip.(32-&64位)
Macos 10.13(高塞拉) BioSigner_1.20.0.tgz.
源存储库 git clone https://git.biocumon.org/packages/bioSigner.
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.biocondion.org:包/生物激情
包短网址 https://biocumon.org/packages/biosigner/
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